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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000714`

染色体: Chr01 坐标: 16024185-16029361 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000714`
名称	SmilChr01G000714
描述	protein SMAX1-LIKE 6-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	16024185 - 16029361 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006729`
GeneID	`131006729`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006729`
原始查询	`LOC131006729`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SMAX1-LIKE 6-like
产物	protein SMAX1-LIKE 6-like
Arabidopsis	`AT2G29970` (AT2G29970) Double Clp-N motif-containing P-loop nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817547] identity=39.5; qcov=0.998; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os11g0104300` (D53) - identity=34; qcov=1.1; evalue=2.63e-150; confidence=low
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF07724 (AAA_2); PF23569 (NBD_SMAX1); PF26587 (AAA_lid_SMAX1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006729

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789844.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057789844.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789844.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789844.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789844.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:16025049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:16025181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr1:16025292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:16025303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr1:16025399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B130,C27,D1
`Chr1:16025480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr1:16025616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:16026954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,D11
`Chr1:16027904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:16028264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr1:16028435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:16028457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789844.1

1084 aa

542

1084

NBD_SMAX1

AAA_2

AAA_lid_SMAX1

PF23569 NBD_SMAX1 221-389 aa PF07724 AAA_2 724-849 aa PF26587 AAA_lid_SMAX1 983-1066 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789844.1`	Pfam	`PF23569`	NBD_SMAX1	Domain	221	389	1.7e-13	51.6	SMAX1 nucleotide binding domain
`XP_057789844.1`	Pfam	`PF07724`	AAA_2	Domain	724	849	5.7e-08	33.7	AAA domain (Cdc48 subfamily)
`XP_057789844.1`	Pfam	`PF26587`	AAA_lid_SMAX1	Domain	983	1066	3.7e-30	104.3	SMAX1-like, AAA+ ATPase lid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933861.1
GAGGGCCTTGAGGCTGTGAAGAAGTAAAGGCGTAGAATCAAAGTAATTTGGTGGCTTCCATGATTAGCAGTTAAAGAGAAGAGCATGATCACACTCTTGAATCTAATCCATTATCAATGGATTTTACCTTTAACAAATCTCTCTTCCTCCAATTCAGATACAGAATCTATGCCTCAAGATTTGGTTGTGATTATGTGATATGCTCCAATTCCATCGCCCTCTTCATTGAGGCCCACTTTCTCTCTCTTCTCGCACCAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006729
ATGCCAACGCCGGTGGGCGTAGCCCGGCAATGCTTGTCGGACTCGGCGGCGGCGGTGCTGGACGACGCCGTGGCGGCAGCGAGGCGCCGCAGTCACGCACAGACGACGACGTTGCACGTGGTGTCCGCTCTACTGGCTGTGACTTCTTCTCCTCTCCGTGAGGCCTGCACACGCGCCTGGAGTAGCGCGTACTCCCCACGGCTCCAGTTCCGCGCGCTGGAGCTCTGTGTCGGCGTCGCGCTCGATAGGGTTTCGGCGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789844.1
MPTPVGVARQCLSDSAAAVLDDAVAAARRRSHAQTTTLHVVSALLAVTSSPLREACTRAWSSAYSPRLQFRALELCVGVALDRVSASKSAAADEPPVSNSLMAAIKRSQASQRRHPDTFHLYQQQLNSGSQNTQSISAVKVELKHFLTSILDDPIVSRVFGDAGFRTQEIKMAVLNPLSISRFAVTASRPPPLFACSPDNFELDRRAHSFPFIDAAAMEKHDENHRKIREVLLKKTRRNPLLIGASGGDAYRNFLDCLKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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