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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000721`

染色体: Chr01 坐标: 16135175-16141570 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000721`
名称	SmilChr01G000721
描述	sodium-dependent phosphate transport protein 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	16135175 - 16141570 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006733`
GeneID	`131006733`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006733`
原始查询	`LOC131006733`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sodium-dependent phosphate transport protein 1, chloroplastic-like
产物	sodium-dependent phosphate transport protein 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G29650` (PHT4;1) phosphate transporter 4;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817515] identity=77; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0279700` (OsPT21) probable anion transporter 1, chloroplastic [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4326905] identity=85.1; qcov=0.811; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF07690 (MFS_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006733

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057789846.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057789846.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057789846.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789846.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789846.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:16139662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,C1,C19,C40,D6
`Chr1:16140628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B97
`Chr1:16141182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr1:16141237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B76,D1,D11,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789846.1

528 aa

264

528

MFS_1

PF07690 MFS_1 109-471 aa

XP_057789847.1

512 aa

256

512

MFS_1

PF07690 MFS_1 109-471 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789846.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	109	471	1.8e-59	202.1	Major Facilitator Superfamily
`XP_057789847.1`	Pfam	`PF07690`	MFS_1	Family	109	471	8.8e-61	206.4	Major Facilitator Superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933864.1
GAATGAGGAATGACTGATTACTAAAGTCAATTTTGTTTAGTAAGAGTGATAGCTGTTTCATCCAATTTAATATACGAGTCTTGAATTTGATTACACATAATTATAGAAAGTGGTGTGGTTATGAGATTCGGAAAATGAAAAAAAAGTCCCAAAATATCAAGAGGGTTAGTTTATCTGGTTTGGAGGCTATCACACGTGGTTGAACCGATCACCACTGCCCCGAACATCAAACTCTCACGGCTCAATTCCAAGATTCCCAT...

XM_057933863.1
AATGAAAAAAAAGTCCCAAAATATCAAGAGGGTTAGTTTATCTGGTTTGGAGGCTATCACACGTGGTTGAACCGATCACCACTGCCCCGAACATCAAACTCTCACGGCTCAATTCCAAGATTCCCATGGAATAAACCAAGGAATTTTCAAGAGTTCCTCGGAACTCATAGCTTTTTCTCTGGTGAGCCATGAACGCCAGAGGTCTGCTCATTTCTCTCAACTCCGCTCACCTCCTCACAACCACCGGAAAAGCCACTCTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006733
ATGAACGCCAGAGGTCTGCTCATTTCTCTCAACTCCGCTCACCTCCTCACAACCACCGGAAAAGCCACTCTTCACTCCAAGTCTCGCCCCTCACCTTTCCACTTTTGCCCCTCCCATTTGCGCCCTACTTACACTGGCAACCGCTTCGTTTCGAGGCTACGATGGGGAAGAGTGCGGGCGGATGTCAAGTCGGAGAAGTATGATATTGCGGAGTCGGCGCCGGACTCAGTTCGACTCGACCAAGCTCCTCCCACGGATGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789846.1
MNARGLLISLNSAHLLTTTGKATLHSKSRPSPFHFCPSHLRPTYTGNRFVSRLRWGRVRADVKSEKYDIAESAPDSVRLDQAPPTDDGGGVALPWWEEFPKRWVIVLLCFSAFLLCNMDRVNMSIAILPMASEYNWSPTTVGLIQSSFFWGYLLTQIAGGIWADTVGGKFVLGFGVVWWSVATILTPVAAKLGLPFLLVVRAFMGIGEGVAMPAMNTILSKWVPVSERSRSLALVYSGMYLGSVTGLAFSPMLIHKFGWP...

XP_057789847.1
MNARGLLISLNSAHLLTTTGKATLHSKSRPSPFHFCPSHLRPTYTGNRFVSRLRWGRVRADVKSEKYDIAESAPDSVRLDQAPPTDDGGGVALPWWEEFPKRWVIVLLCFSAFLLCNMDRVNMSIAILPMASEYNWSPTTVGLIQSSFFWGYLLTQIAGGIWADTVGGKFVLGFGVVWWSVATILTPVAAKLGLPFLLVVRAFMGIGEGVAMPAMNTILSKWVPVSERSRSLALVYSGMYLGSVTGLAFSPMLIHKFGWP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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