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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001863`

染色体: Chr01 坐标: 33583866-33584270 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001863`
名称	SmilChr01G001863
描述	uncharacterized SmilChr01G001863
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33583866 - 33584270 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006742`
GeneID	`131006742`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006742`
原始查询	`LOC131006742`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=45.8; qcov=0.881; evalue=1.32e-21; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=51.3; qcov=0.888; evalue=3.64e-35; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006742

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789854.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789854.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789854.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789854.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789854.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33583891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	C2,C50,C83
`Chr1:33583891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C50,C83
`Chr1:33583906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B67,C67,D4
`Chr1:33583927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B69,C42,D10
`Chr1:33583943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr1:33583984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,C40,C55
`Chr1:33583987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr1:33583994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A22,A4,A6,B10,B135,B2,B28,B58,B67,B9,C11,C25,C37,C39,C40,C46,C55,C69,C77,C81,C87,D4
`Chr1:33583995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B40,B69,C39,C42
`Chr1:33584025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:33584028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B139,B64,C37
`Chr1:33584035`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789854.1

134 aa

134

DUF8418

PF28509 DUF8418 25-63 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789854.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	25	63	8.2e-19	67.8	Domain of unknown function (DUF8418)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933871.1
ATGTTCTCCCAACCGGAGCCAGAACGTGTTATTTACCATCTGTCTTACGTCTACCGTGATCGTGAGGCTGCCCATTTACGTCTTATGCAAGACTACTTCAACGACAATCCGACGTACGGGCCTACATTTTTCCGACGGCGTTTTCGAATACATAAGGAGTTGTTTTTGCGCATCGTCGATGCTGTGCAAGGTGAAGATGGTTACTTCCGGATGAGCCATGATGTTGTGGGCCGGGACTCTCTCACGCCTTTGCAGAAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006742
ATGTTCTCCCAACCGGAGCCAGAACGTGTTATTTACCATCTGTCTTACGTCTACCGTGATCGTGAGGCTGCCCATTTACGTCTTATGCAAGACTACTTCAACGACAATCCGACGTACGGGCCTACATTTTTCCGACGGCGTTTTCGAATACATAAGGAGTTGTTTTTGCGCATCGTCGATGCTGTGCAAGGTGAAGATGGTTACTTCCGGATGAGCCATGATGTTGTGGGCCGGGACTCTCTCACGCCTTTGCAGAAATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789854.1
MFSQPEPERVIYHLSYVYRDREAAHLRLMQDYFNDNPTYGPTFFRRRFRIHKELFLRIVDAVQGEDGYFRMSHDVVGRDSLTPLQKCTAAIRQLATDVNVDTFDEYLKIADTTGRICLKKFCKAVIWAYGAEYL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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