当前解析结果
SmilChr01G000747| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000747 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000747 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000747 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 16551282 - 16555327 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006759 |
|---|---|
| GeneID | 131006759 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006759 |
| 原始查询 | LOC131006759 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836080]; symbol=AT5G59610; hit=AT5G59610; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836080]; symbol=AT5G59610; hit=AT5G59610; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G59610 (AT5G59610)Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836080] identity=58.3; qcov=0.808; evalue=9.29e-78; confidence=high |
| Rice | Os03g0822800 (OsDjC36)- identity=52.1; qcov=0.591; evalue=3.48e-46; confidence=medium |
| GO | GO:0005737 (cytoplasm); GO:0042026 (protein refolding); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0051085 (GO:0051085) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00226 (DnaJ) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006759 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057789871.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 1.00000 | XP_057789871.1 |
| 3 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.80000 | XP_057789872.1 |
| 4 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.20000 | XP_057789871.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057789871.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:16555006 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A4,B103 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057789871.1PF00226
DnaJ 80-140 aa
XP_057789872.1PF00226
DnaJ 80-140 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057789871.1 |
Pfam | PF00226 |
DnaJ | Domain | 80 | 140 | 2.4e-23 | 82.7 | DnaJ domain |
XP_057789872.1 |
Pfam | PF00226 |
DnaJ | Domain | 80 | 140 | 2.1e-23 | 82.9 | DnaJ domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。