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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000748`

染色体: Chr01 坐标: 16556310-16560632 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000748`
名称	SmilChr01G000748
描述	protein TOC75-3, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	16556310 - 16560632 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006761`
GeneID	`131006761`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006761`
原始查询	`LOC131006761`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TOC75-3, chloroplastic-like
产物	protein TOC75-3%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G46740` (TOC75-III) translocon at the outer envelope membrane of chloroplasts 75-III [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823827] identity=85.6; qcov=0.843; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0271200` (TOC75) - identity=71.8; qcov=0.853; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009658 (chloroplast organization); GO:0009707 (chloroplast outer membrane); GO:0015450 (protein-transporting ATPase activity); GO:0045037 (protein import into chloroplast stroma)
KEGG	-
Pfam	PF01103 (Omp85); PF25280 (POTRA2_Toc75); PF25282 (POTRA1_3_Toc75)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006761

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057789873.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057789873.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.60000	`XP_057789873.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057789873.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789873.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:16557729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D5
`Chr1:16557870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789873.1

815 aa

408

815

POTRA1_3_Toc75

POTRA2_Toc75

POTRA1_3_Toc75

Omp85

PF25282 POTRA1_3_Toc75 151-242 aa PF25280 POTRA2_Toc75 251-362 aa PF25282 POTRA1_3_Toc75 363-444 aa PF01103 Omp85 483-815 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789873.1`	Pfam	`PF25282`	POTRA1_3_Toc75	Domain	151	242	3.4e-69	230.0	Toc75-like, POTRA domain
`XP_057789873.1`	Pfam	`PF25280`	POTRA2_Toc75	Domain	251	362	4.5e-60	201.4	Toc75-like, second POTRA domain
`XP_057789873.1`	Pfam	`PF25282`	POTRA1_3_Toc75	Domain	363	444	3.4e-69	230.0	Toc75-like, POTRA domain
`XP_057789873.1`	Pfam	`PF01103`	Omp85	Domain	483	815	1.1e-17	65.3	Omp85 superfamily domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933890.1
AATTTATAAACCCTCGGACCGCCTTCTTCCACTCTCACCCGCCCCCCTCTGCCTTATCGCCCCCTAATGTCGACGTTCTCCGCGGCGGCGCATCTCCTTCCCCTCACTTCCTCCGCAGCCTCCCGCCGTCGCCGCAATGGCACCACAAGCACCGCCGTTTCCGCTCTCCACTCCCCTACTTCCATTTTGCAATGCAGTCTCCCCTCTCCCGCCGCCTCCTCCTCCTCCCAAAACCCTAAACCTTCGAAATCTCCGCCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006761
ATGTCGACGTTCTCCGCGGCGGCGCATCTCCTTCCCCTCACTTCCTCCGCAGCCTCCCGCCGTCGCCGCAATGGCACCACAAGCACCGCCGTTTCCGCTCTCCACTCCCCTACTTCCATTTTGCAATGCAGTCTCCCCTCTCCCGCCGCCTCCTCCTCCTCCCAAAACCCTAAACCTTCGAAATCTCCGCCTTTCCCATTGAGCTCCATTGTCTCACCCAAATCCATCGCTGTGTCCGCTGCCTCCTGCATTCTCTTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789873.1
MSTFSAAAHLLPLTSSAASRRRRNGTTSTAVSALHSPTSILQCSLPSPAASSSSQNPKPSKSPPFPLSSIVSPKSIAVSAASCILFSIANPILSGGDFIFNFGGGGGGGGGGGGGGGNGGGEGGGFWSFLPAAAIAKDDDPQQDWDSHGLPANIVVQLNKLSGFKKYKVSEILFFDRRRGSSVGTEDSFFEMVSLRPGGVYNKAQLQKELETLATCGMFEKVDLETKTNPDGSINITIPFLESTWQSADRFRCINVGLMP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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