当前解析结果
SmilChr01G001898| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001898 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001898 |
| 描述 | glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 34089976 - 34090299 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006793 |
|---|---|
| GeneID | 131006793 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006793 |
| 原始查询 | LOC131006793 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like |
| 产物 | glycine-rich cell wall structural protein 1.8-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006793 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057789917.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057789917.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057789917.1 |
| 4 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057789917.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789917.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:34089980 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr1:34089988 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B69 |
Chr1:34089989 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr1:34090014 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B69,C74 |
Chr1:34090043 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B47 |
Chr1:34090043 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B47 |
Chr1:34090047 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B64 |
Chr1:34090057 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:34090086 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A21,C74 |
Chr1:34090090 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B41,C64 |
Chr1:34090096 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B134 |
Chr1:34090111 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B36,C62 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。