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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000792`

染色体: Chr01 坐标: 17210660-17213026 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000792`
名称	SmilChr01G000792
描述	protein PLASTID TRANSCRIPTIONALLY ACTIVE 16, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	17210660 - 17213026 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006794`
GeneID	`131006794`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006794`
原始查询	`LOC131006794`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PLASTID TRANSCRIPTIONALLY ACTIVE 16, chloroplastic
产物	protein PLASTID TRANSCRIPTIONALLY ACTIVE 16%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G46780` (PTAC16) plastid transcriptionally active 16 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823831] identity=59.5; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0291700` - identity=52.7; qcov=1.05; evalue=1.01e-141; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13460 (NAD_binding_10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006794

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057789916.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057789916.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.80000	`XP_057789916.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057789916.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789916.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:17210956`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:17210956`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:17211046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:17212009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C56,C60
`Chr1:17212094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:17212193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789916.1

479 aa

240

479

NAD_binding_10

PF13460 NAD_binding_10 85-292 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789916.1`	Pfam	`PF13460`	NAD_binding_10	Domain	85	292	3.2e-10	40.9	NAD(P)H-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933933.1
AACAGCACCAAATGGCGGAGTCTGATTGGGCAGGGCAAGGATATCCAATCACCAGAAAAAACGAACTCAACATTCTATCTTCCTCACTTGGATACTGTGACTCTCTCATTCCTCAACACAACCTGAATGGATAAACCAAGTATGATGATTCTCTGATCATTCATCTCTCCTCCCCATTCATTCATGGCGCCTACTCTCTCTTCAAATTCCTTCCTCCTCACCACCACTCCTCCTTCAAGCTACTATCTCCGCCCGCCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006794
ATGGCGCCTACTCTCTCTTCAAATTCCTTCCTCCTCACCACCACTCCTCCTTCAAGCTACTATCTCCGCCCGCCCACTCTCTTCGCCAAGAAGTCCGATGACGAACCCCAGCTGGATTCTGCCAAGAATTCCAACCCCTTCCGCTTTGATTTCGGGAAGTTGCCCGATGTCAAGTCTCTAGTCCCGGTCGTGGCCAGCCCATCGTCTGGATTGGCTTTCCGCCGTAAGGAAGCTGGCACGGTGTTCGTGGCAGGCGCAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789916.1
MAPTLSSNSFLLTTTPPSSYYLRPPTLFAKKSDDEPQLDSAKNSNPFRFDFGKLPDVKSLVPVVASPSSGLAFRRKEAGTVFVAGATGQAGIRIAQTLLRQGFSVRAGVPDLVAAQELARLAAQYKIISIEESRRLNAVASVFDNAESIAKAIGNASKVVVTIGAGENGPSGLVTTTDALLVVEAAQLANVGHVAIIYDEAAGISSTYNVLDGITSFFNNLFAKSQPLTITEFLQSVVKTDVSYTLIKTKLTEDFSPESS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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