当前解析结果
SmilChr01G000801| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000801 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000801 |
| 描述 | D-xylose-proton symporter-like 3, chloroplastic |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 17291605 - 17295058 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131006799 |
|---|---|
| GeneID | 131006799 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006799 |
| 原始查询 | LOC131006799 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | D-xylose-proton symporter-like 3, chloroplastic |
| 产物 | D-xylose-proton symporter-like 3%2C chloroplastic |
| Arabidopsis | AT5G59250 (AT5G59250)Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836043] identity=71.2; qcov=0.959; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os10g0579200- identity=62.7; qcov=0.836; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00083 (Sugar_tr); PF07690 (MFS_1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006799 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057789924.1 |
| 2 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 1.00000 | XP_057789924.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057789924.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057789924.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789924.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:17292051 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057789924.1PF00083
Sugar_tr 107-557 aa
PF07690
MFS_1 123-508 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057789924.1 |
Pfam | PF00083 |
Sugar_tr | Family | 107 | 557 | 2.8e-93 | 314.0 | Sugar (and other) transporter |
XP_057789924.1 |
Pfam | PF07690 |
MFS_1 | Family | 123 | 508 | 1.4e-31 | 110.4 | Major Facilitator Superfamily |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。