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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000807`

染色体: Chr01 坐标: 17446147-17451041 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000807`
名称	SmilChr01G000807
描述	uncharacterized SmilChr01G000807
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	17446147 - 17451041 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006804`
GeneID	`131006804`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006804`
原始查询	`LOC131006804`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT2G29510; symbol=AT2G29510; hit=AT2G29510; species=arabidopsis; confidence=low
产物	AT2G29510; symbol=AT2G29510; hit=AT2G29510; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G29510` (AT2G29510) - identity=34.1; qcov=0.632; evalue=1.84e-60; confidence=low
Rice	`Os03g0267600` - identity=31.6; qcov=0.526; evalue=4.51e-44; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12043 (DUF3527)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006804

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057789935.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057789935.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057789935.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789935.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789935.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:17446947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:17447242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B25,D6
`Chr1:17447364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr1:17447407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:17447680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr1:17447717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,C27,C41
`Chr1:17447737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789935.1

886 aa

443

886

DUF3527

PF12043 DUF3527 557-665 aa PF12043 DUF3527 673-841 aa

XP_057789936.1

886 aa

443

886

DUF3527

PF12043 DUF3527 557-665 aa PF12043 DUF3527 673-841 aa

XP_057789937.1

886 aa

443

886

DUF3527

PF12043 DUF3527 557-665 aa PF12043 DUF3527 673-841 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789935.1`	Pfam	`PF12043`	DUF3527	Family	557	665	7.6e-48	164.5	Domain of unknown function (DUF3527)
`XP_057789935.1`	Pfam	`PF12043`	DUF3527	Family	673	841	7.6e-48	164.5	Domain of unknown function (DUF3527)
`XP_057789936.1`	Pfam	`PF12043`	DUF3527	Family	557	665	7.6e-48	164.5	Domain of unknown function (DUF3527)
`XP_057789936.1`	Pfam	`PF12043`	DUF3527	Family	673	841	7.6e-48	164.5	Domain of unknown function (DUF3527)
`XP_057789937.1`	Pfam	`PF12043`	DUF3527	Family	557	665	7.6e-48	164.5	Domain of unknown function (DUF3527)
`XP_057789937.1`	Pfam	`PF12043`	DUF3527	Family	673	841	7.6e-48	164.5	Domain of unknown function (DUF3527)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933953.1
AAGCTACTCTGAGAGGTGCGGACCCCGGCGGATGTGACCTCCCGCGTTTTACTCCTCCATTCTCAGCCGTCCGATCTCATCCATCTCCAGACCTAGAAAAACCACCACATTCTTTTCGAATCCGAATGTGAATCCAACTTGTTCATTGTTTTCTCTCTTTGATTCTGCATTATTCACTTGGAAAAGCCGCTATCAGTTCCGTCTTTGGATCATCGGATTCCGCCCTTTTCCATCTCTGATTTGCTGCGCTCCTTTTCCCA...

XM_057933952.1
GATTATCGCCGTTTGTTTATTATTTCTGTTCGGTGGCATTTCCTGTTCATTTGGCGCTACGTTAAGAAATTTGATTTCTGTTTGTCAAGCAAATCTAGTTCACTGATGTGGTTTTTGAACCCACCCTCCAATTACGTGTAGATGCAGAAGGTGTGATCTCTCTTGTTTAATTTATTTGAATTTGTGCCTGTGTGGGTTGGCCAGTTGGTAGGGATAAAAAAAAAATTAAAGGGGGGTGGTCTGGAGCGGATTAAAGCAAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131006804
ATGCATGTTACTAGCAAGATGGGGTTTCATTCAAATGGTGGTGAGGAGTCATATGATACAAAAGCGAGTAAATTAAATATCGGTTTGTCAACCCAACCGAAACAGAGGAAGAAACTGGGGTCCATTTTGAACTTGGAGGAATATGAGAATGATTTACATCCACGAGCTGTGAAGGATGCAGAAAAATCTAAAGGGTTTCATCAGAAGCAACACGACGAAAGAAAGTTGTGCAAAAGTGAAGAAGTTGTTAGGTACATGTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057789935.1
MHVTSKMGFHSNGGEESYDTKASKLNIGLSTQPKQRKKLGSILNLEEYENDLHPRAVKDAEKSKGFHQKQHDERKLCKSEEVVRYMSCLPSYLERGENPEKLFNIGVLDWGQLEKWQHSNADILGINVEPSPSSSTSSSFVSSKASSSRPSSKNTMSHHHRKLNRPSTSTGCRSSALELLAGGGETLPKHRNDSNNLLRVQQDLLQATQSSNLDRANWQKDSRRLDPSLQKVTKLRSRPSETDSIVSGFKGNGTLRKGEA...

XP_057789936.1
MHVTSKMGFHSNGGEESYDTKASKLNIGLSTQPKQRKKLGSILNLEEYENDLHPRAVKDAEKSKGFHQKQHDERKLCKSEEVVRYMSCLPSYLERGENPEKLFNIGVLDWGQLEKWQHSNADILGINVEPSPSSSTSSSFVSSKASSSRPSSKNTMSHHHRKLNRPSTSTGCRSSALELLAGGGETLPKHRNDSNNLLRVQQDLLQATQSSNLDRANWQKDSRRLDPSLQKVTKLRSRPSETDSIVSGFKGNGTLRKGEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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