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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000819`

染色体: Chr01 坐标: 17691036-17694890 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000819`
名称	SmilChr01G000819
描述	ribosome biogenesis protein BRX1 homolog 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	17691036 - 17694890 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006814`
GeneID	`131006814`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006814`
原始查询	`LOC131006814`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribosome biogenesis protein BRX1 homolog 2-like
产物	ribosome biogenesis protein BRX1 homolog 2-like
Arabidopsis	`AT3G15460` (AT3G15460) Ribosomal RNA processing Brix domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820785] identity=73.7; qcov=1; evalue=8.54e-173; confidence=high
Rice	`Os02g0591800` - identity=73; qcov=1.04; evalue=1.91e-162; confidence=high
GO	GO:0000027 (ribosomal large subunit assembly); GO:0005730 (nucleolus); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0019843 (rRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF04427 (Brix)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006814

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789947.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057789947.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789947.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789947.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789947.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:17692561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr1:17692723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,B50
`Chr1:17693060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C39,D7
`Chr1:17693084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr1:17693485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr1:17693491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr1:17693500`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr1:17693924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B37
`Chr1:17694148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,B75
`Chr1:17694292`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B53
`Chr1:17694292`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B53
`Chr1:17694297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,C35,C42,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789947.1

315 aa

158

315

Brix

PF04427 Brix 60-250 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789947.1`	Pfam	`PF04427`	Brix	Domain	60	250	2.6e-46	158.8	Brix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933964.1
GTAAAACCTAGCCGTTTCTTTGTTCTCACTCTCGTCTCCTCCCTCTCTCTGCCATCGCACGCTCTCGGTCTCTTTCACTTTCTTTCTCGTCTTCGGCCTCTCATTGCAGCCGCCGTCGCCGGCTCCCGCGTCTCCCAGTCTCCCTCATCTCCTCATCTTTCGATGCACCGCCGCCCTCGCTAACTCGCCCGGCCTTCCCCGTCGCCGGCTTGCCCAACCCCCTCGTCTCTCAGTCTCCCTCGCCGCCGACTCGCCCTGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006814
ATGGGGAAGAAGAGAAAGCACAGCGAAACCAATGCGGCGGAGAATGAGAAGAAGGAAGAAATCGCGCCGGAACGGCCGAAAAGAACGCTTTTCGGATTTAAAACCAGTCCTCAAGATATAAAGGAGAATGATACTACCCCTTTCTTCCGGAATAAAGAGAAAGTTTTGGTTACTTGTTCTCGCCGCATTAGTTACAGGTATCGGCATTTGATGTTGAACTTAGTTGATTTATTGCCTCATTGTAAGAAAGATAACAAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789947.1
MGKKRKHSETNAAENEKKEEIAPERPKRTLFGFKTSPQDIKENDTTPFFRNKEKVLVTCSRRISYRYRHLMLNLVDLLPHCKKDNKVESKGSKGTDLNELVELRSCSSCLFFECRKGKDLYLWMSKCPNGPSVKFLVNAVHTMEELKLTGNHLKGSRPILTFSSNFDKKPHFQLLKEMITQIFATPKDHRKSKPYHDHVFVFSIADDHIWFRNYQISSGHTGTAQKLDRGDLEKMTLVEVGPRFCLNPIKIFSGSFGGPT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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