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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000837`

染色体: Chr01 坐标: 18083466-18086953 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000837`
名称	SmilChr01G000837
描述	uncharacterized SmilChr01G000837
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	18083466 - 18086953 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006828`
GeneID	`131006828`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006828`
原始查询	`LOC131006828`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0280000; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0280000; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G15140` (AT3G15140) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820745] identity=26.1; qcov=0.713; evalue=2.66e-21; confidence=low
Rice	`Os01g0280000` - identity=64.9; qcov=0.817; evalue=1.41e-143; confidence=high
GO	GO:0000175 (3'-5'-RNA exonuclease activity); GO:0000467 (exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00929 (RNase_T); PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006828

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789969.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789969.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057789970.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057789969.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057789969.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:18084323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr1:18085393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr1:18085442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B78,C39,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789969.1

404 aa

202

404

RNase_T

Zn_ribbon_GRF

PF00929 RNase_T 142-311 aa PF06839 Zn_ribbon_GRF 358-402 aa

XP_057789970.1

387 aa

194

387

RNase_T

Zn_ribbon_GRF

PF00929 RNase_T 125-294 aa PF06839 Zn_ribbon_GRF 341-385 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789969.1`	Pfam	`PF00929`	RNase_T	Domain	142	311	2.8e-26	93.7	Exonuclease
`XP_057789969.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	358	402	6.1e-07	30.2	GRF zinc finger
`XP_057789970.1`	Pfam	`PF00929`	RNase_T	Domain	125	294	2.6e-26	93.8	Exonuclease
`XP_057789970.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	341	385	5.7e-07	30.3	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933987.1
GAATCATGAAACTGTATTAGAATAATATATAGAAAATATGACATGTAAACGCCAAAACATAATACATATCCATTTATTGCCTCAAAACCAGCAGCAGCAAACGCTCTCTTCGCAAATCGCAGCGCTAACAAGTGCAATTACAGAGTGAGATTTCATGTGCTTTGCCCCGGATCTTCGTAGCTTTTGTATGCATGATGATATCTTTGGATAATAAAGGTTACTTCTGCTCTCCGTCACATAAAGCCACCTACTTAGAAGGT...

XM_057933986.1
GAATCATGAAACTGTATTAGAATAATATATAGAAAATATGACATGTAAACGCCAAAACATAATACATATCCATTTATTGCCTCAAAACCAGCAGCAGCAAACGCTCTCTTCGCAAATCGCAGCGCTAACAAGTGCAATTACAGAGTGAGATTTCATGTGCTTTGCCCCGGATCTTCGTAGCTTTTGTATGCATGATGATATCTTTGGATAATAAAGATGCTCTGCAGAGTAATCGTGAGAATTCACTAAAAAAGATTCAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131006828
ATGATGATATCTTTGGATAATAAAGGTTACTTCTGCTCTCCGTCACATAAAGCCACCTACTTAGAAGGTTTTCCAGAGTTGGAAGATGATGCCCCTGCTCAATCAGGTGCGGGTGCTGTAGATCAAGATTGCCCCTTAAGCAGTGAGCTAGTAGAACCTTCAGAGGAATCTACGAAGAGGCCATTATATTATCATGACTTTGGCAAATGGTCTAGGAATCCTGGCTGTAACAATGCTCTTATGTGCCAACTGAATGTCTT...

LOC131006828
ATGATGATATCTTTGGATAATAAAGATGCTCTGCAGAGTAATCGTGAGAATTCACTAAAAAAGATTCAAAACACAGGTTACTTCTGCTCTCCGTCACATAAAGCCACCTACTTAGAAGGTTTTCCAGAGTTGGAAGATGATGCCCCTGCTCAATCAGGTGCGGGTGCTGTAGATCAAGATTGCCCCTTAAGCAGTGAGCTAGTAGAACCTTCAGAGGAATCTACGAAGAGGCCATTATATTATCATGACTTTGGCAAATG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057789969.1
MMISLDNKDALQSNRENSLKKIQNTGYFCSPSHKATYLEGFPELEDDAPAQSGAGAVDQDCPLSSELVEPSEESTKRPLYYHDFGKWSRNPGCNNALMCQLNVFHAHFHPFAMNYRFQRVPVHMMAQSYLHDKQFQDFQYFVVIDFEATCDKERIPYPQEIIEFPSVIVSSITGQLEDSFQTYVRPTCNQHLTDFCKDLTGIQQVQVDRGVSLSEALLSHDKWLENKGIKNSNFAIVTWSDWDCQVMLESECRFKRIRKP...

XP_057789970.1
MMISLDNKGYFCSPSHKATYLEGFPELEDDAPAQSGAGAVDQDCPLSSELVEPSEESTKRPLYYHDFGKWSRNPGCNNALMCQLNVFHAHFHPFAMNYRFQRVPVHMMAQSYLHDKQFQDFQYFVVIDFEATCDKERIPYPQEIIEFPSVIVSSITGQLEDSFQTYVRPTCNQHLTDFCKDLTGIQQVQVDRGVSLSEALLSHDKWLENKGIKNSNFAIVTWSDWDCQVMLESECRFKRIRKPPYFNKWINLRVPFREVF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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