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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001922`

染色体: Chr01 坐标: 34352275-34352754 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001922`
名称	SmilChr01G001922
描述	uncharacterized SmilChr01G001922
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	34352275 - 34352754 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006854`
GeneID	`131006854`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006854`
原始查询	`LOC131006854`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G02650` (AT2G02650) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814794] identity=31.6; qcov=0.717; evalue=3.34e-09; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=28.6; qcov=0.836; evalue=2.84e-09; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006854

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057789992.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057789992.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789992.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789992.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789992.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:34352328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B33,B8,B94
`Chr1:34352356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B46,B56,B69,B96,C26,C4,C5
`Chr1:34352362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A18,B109,B115,B29,C45
`Chr1:34352362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B109,B115,B29,C45
`Chr1:34352407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B129
`Chr1:34352424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B8,B81,C58
`Chr1:34352446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B13,C20,C21,C71
`Chr1:34352463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,D10
`Chr1:34352467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr1:34352467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:34352485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B7,C20,C21,C71
`Chr1:34352545`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	135	A1,A10,A11,A13,A18,A19,A21,A4,A7,A8,A9,B10,B100,B101,B105,B106,B111,B114,B117,B118,B119,B12,B121,B122,B123,B125,B128,B13,B132,B136,B137,B138,B16,B17,B18,B2,B20,B21,B22,B23,B26,B27,B28,B29,B30,B33,B34,B35,B36,B37,B40,B41,B44,B47,B50,B52,B54,B55,B56,B62,B63,B64,B72,B73,B75,B79,B80,B82,B86,B88,B89,B9,B93,B95,B96,B98,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C2,C20,C25,C27,C28,C30,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C4,C41,C43,C44,C48,C49,C5,C52,C53,C56,C58,C59,C6,C60,C62,C64,C66,C68,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C75,C79,C8,C81,C82,C83,C84,C9,D1,D10,D4,D5,D6,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789992.1

159 aa

159

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 2-55 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789992.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	2	55	7e-12	46.6	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934009.1
ATGACAGCGTGGAGAATGTTGAAAAATCGACTTCCGACATGTGATAACTTGAGGAAAATGAAGATTCTGCTGAACGATGAAGAATCCAAATGCTTTGAATGCGGGATGCAGGAAGAATCGATCAATCATCTCTTCCTCATCTGCCCGAAGACGGATGAGGTGTGGAACGAAGTGCAGAAGTGGTTGGGAGTTGCAACAGTACGCCCAAATCATTTTGAAAAACATCTAGGTACGTTCACTTCTTTTGGAAAAGAAAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006854
ATGACAGCGTGGAGAATGTTGAAAAATCGACTTCCGACATGTGATAACTTGAGGAAAATGAAGATTCTGCTGAACGATGAAGAATCCAAATGCTTTGAATGCGGGATGCAGGAAGAATCGATCAATCATCTCTTCCTCATCTGCCCGAAGACGGATGAGGTGTGGAACGAAGTGCAGAAGTGGTTGGGAGTTGCAACAGTACGCCCAAATCATTTTGAAAAACATCTAGGTACGTTCACTTCTTTTGGAAAAGAAAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789992.1
MTAWRMLKNRLPTCDNLRKMKILLNDEESKCFECGMQEESINHLFLICPKTDEVWNEVQKWLGVATVRPNHFEKHLGTFTSFGKEKKIRNLLLAIWVGCIWILWKKRNERRFSGKEWNCKNFVLEIKIRLWSWNRIFEIVDDGMDLEVWCSNDLICKLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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