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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000893`

染色体: Chr01 坐标: 18979266-18980289 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000893`
名称	SmilChr01G000893
描述	uncharacterized SmilChr01G000893
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	18979266 - 18980289 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006873`
GeneID	`131006873`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006873`
原始查询	`LOC131006873`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006873

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057790007.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057790007.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057790007.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057790007.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790007.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:18979726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C37
`Chr1:18979740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B39,B57,C54,C74,C87
`Chr1:18979746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B91,C7,C74
`Chr1:18979790`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	A20,B120,B22,B3,B35,B67,B74,B91,C13,C28,C54,C82,C87
`Chr1:18979818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B91,C43
`Chr1:18979820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	50	A11,A21,A23,A24,A25,B11,B111,B113,B123,B128,B130,B138,B14,B23,B27,B28,B32,B38,B39,B44,B45,B5,B56,B62,B69,B72,B85,C10,C11,C14,C18,C2,C24,C29,C3,C31,C33,C42,C43,C49,C50,C58,C69,C73,C76,C77,C79,C80,C83,C85
`Chr1:18979934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C21
`Chr1:18979940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B125,B2,B90,C6
`Chr1:18979940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B2,B90,C6
`Chr1:18979954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,D7
`Chr1:18979968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:18980005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	126	A10,A13,A14,A15,A16,A19,A2,A20,A21,A22,A24,A3,A5,A8,A9,B1,B100,B106,B107,B11,B110,B111,B113,B115,B117,B118,B121,B124,B125,B126,B128,B131,B132,B133,B137,B139,B14,B15,B16,B18,B20,B23,B24,B29,B3,B31,B32,B35,B36,B40,B46,B48,B5,B51,B52,B53,B56,B60,B61,B62,B65,B66,B67,B68,B7,B70,B71,B73,B77,B79,B80,B81,B82,B88,B89,B9,B93,B94,B95,C1,C11,C15,C16,C18,C19,C2,C20,C21,C25,C26,C27,C28,C3,C30,C31,C39,C40,C42,C44,C47,C48,C49,C5,C50,C53,C55,C57,C58,C62,C69,C70,C72,C75,C76,C77,C78,C8,C80,C82,C86,C87,D1,D10,D11,D4,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790007.1

155 aa

155

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 21-61 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790007.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	21	61	5.2e-09	36.8	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934024.1
AGGGGTAATTGCCTGTAAATTCCTAACGTTTACTCGAAATTGGTTTTCGCTTCCATTTTCTAAGGTCTTGCGTCTAATTACCTAACCTTTTTTTTTGTCTGATTTAGCACCCGTCGTCGGTTTTTCCCAAATTTTAAATGACGTGTCACCGGGAAATGACAGCGTGGCGCTGGATTTTGCACAGTTGGAAGCCGGAATGAAAAAAAGAAACGACGCCGTTTCTAATTAAAAGAAACAACGTCGTTTCGCCATGTAATAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006873
ATGTCGTCTACTTCCTCTTCCTCAAATTCGAGCTTCAATCGCGGAGTTTCTCAGCAGGTTGTTTGTGTTCATGAAATTGCAGCTACAATGAACACCTCCCACACTGAAAAGAATCCTGAGAGGCGATTCTATTGTTGTAGTCGAACAAAGGCTGAAAATTGTGGATTTTGGAGATGGAAGGATCCAGAGCTTAGTTCGTACTATAAGATGTGCATAAACAAGCTAATTCTTCAACGAGACAAAGTGTCCGAGGAGCTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790007.1
MSSTSSSSNSSFNRGVSQQVVCVHEIAATMNTSHTEKNPERRFYCCSRTKAENCGFWRWKDPELSSYYKMCINKLILQRDKVSEELKLCKFMGEMQAEKYEDLMTLYEVKCADVEEMKIVMKEQELEISNLKWKLRITKLLLVLIFGVLAMNHFL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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