当前解析结果
SmilChr01G000905| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000905 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000905 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000905 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 19137035 - 19138987 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131006881 |
|---|---|
| GeneID | 131006881 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006881 |
| 原始查询 | LOC131006881 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os06g0523701- identity=35.6; qcov=0.396; evalue=1.41e-08; confidence=low |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006881 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790012.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057790012.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790012.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790012.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057790012.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:19137598 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 47 | A10,A16,B118,B119,B129,B136,B140,B19,B29,B32,B33,B38,B39,B41,B45,B48,B49,B57,B59,B63,B71,B75,B78,B82,B9,B99,C1,C13,C14,C26,C27,C34,C40,C45,C54,C60,C61,C62,C72,C74,C84,C9,D10,D5,D7,D8,D9 |
Chr1:19137611 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | B123,B64,C16,C26,C37,C5 |
Chr1:19137635 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B25,C80 |
Chr1:19137639 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B25,C80 |
Chr1:19137662 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C27 |
Chr1:19137667 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B99 |
Chr1:19137672 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B19,B49,C12 |
Chr1:19137683 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B49,B71,B99 |
Chr1:19137684 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B135,C2 |
Chr1:19137686 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C2,C52 |
Chr1:19137690 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C9 |
Chr1:19137690 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。