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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001925`

染色体: Chr01 坐标: 34395602-34397400 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001925`
名称	SmilChr01G001925
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	34395602 - 34397400 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006886`
GeneID	`131006886`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006886`
原始查询	`LOC131006886`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=39; qcov=0.67; evalue=5.59e-65; confidence=medium
Rice	`Os09g0479500` - identity=39.4; qcov=0.759; evalue=1.91e-80; confidence=medium
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006886

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057790018.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790018.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790018.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790018.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790018.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:34395686`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:34395736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B84,C30
`Chr1:34395855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr1:34395877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:34396012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:34396033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr1:34396039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr1:34396136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:34396183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:34396232`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A7,B119,B127,B17,B23,B43,B44,B50,B56,B74,B77,B83,B85,C16,C23,C53,C59,C60,C61,C72,C79,C82,D4,D5
`Chr1:34396237`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	24	A7,B119,B127,B17,B23,B43,B44,B50,B56,B74,B77,B83,B85,C16,C23,C53,C59,C60,C61,C72,C79,C82,D4,D5
`Chr1:34396259`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	26	A7,B119,B127,B129,B17,B23,B43,B44,B50,B56,B74,B77,B83,B85,C12,C16,C23,C53,C59,C60,C61,C72,C79,C82,D4,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790018.1

528 aa

264

528

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 150-312 aa PF23559 WHD_DRP 395-465 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790018.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	150	312	7.2e-41	140.4	NB-ARC domain
`XP_057790018.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	395	465	7.6e-22	77.9	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934035.1
TTAGAAATATGCACAAATAATACGAAAATTAGTTGCTTGCATGTGCAGGTTCAATGCATAGATCTCAATGAATAAAATATTTGAACTTGAAAATATGTAATTAATTAAGCATGGATTCACACCATATAGCCTATCTCATGTCAGATCAAAAATTCAACTCTTCATCATAAGATCAAGTCAATTTATTCAAAAAAATATATCAGAGGTTAAAGATGGCGGCTTATGCATCTCTAGTTTCTTTGTTGAATACTATGGAGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006886
ATGGCGGCTTATGCATCTCTAGTTTCTTTGTTGAATACTATGGAGCAGATCCAGACTCATCCTCTCCTCTCTACTTGTTTCGACAAGTACCAGAATGAATCTCTTCGCACAAAGGTTGATTTCTTTCTGGATTTTGTAGAGAATTATTCAGATGCAGGCAGCAGAGAAGCAGACGATTTGCTGAGGCGAATTGCATTCGTGGCTCATGCGGCTGAAGATATAACCGAATGCGAAGCAACAGATCGAGTTCGTGCTGTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790018.1
MAAYASLVSLLNTMEQIQTHPLLSTCFDKYQNESLRTKVDFFLDFVENYSDAGSREADDLLRRIAFVAHAAEDITECEATDRVRAVSTKKRLQMLLHLQRIIDGMFSIEEKVIKFKEETGCINRQPSYSTSSAASVKTAAMVGFDGYLVQLLDQLTGQPPERRIISIVGMGGIGKTTLARNMYENRLTVQHFDVRAWVTVSQDYNAREILKEALSCLGGLSSNIGEDQLGEELHKTLYGRRYLIILDDVWSVEVWDRMNF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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