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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000937`

染色体: Chr01 坐标: 19844941-19845735 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000937`
名称	SmilChr01G000937
描述	glyoxylase I 4
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	19844941 - 19845735 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006898`
GeneID	`131006898`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006898`
原始查询	`LOC131006898`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glyoxylase I 4
产物	glyoxylase I 4
Arabidopsis	`AT2G28420` (GLYI8) Lactoylglutathione lyase / glyoxalase I family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817390] identity=65.9; qcov=0.859; evalue=1.89e-86; confidence=high
Rice	`Os07g0657100` (GLYI10) - identity=62.6; qcov=0.795; evalue=7.6e-77; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00903 (Glyoxalase); PF13669 (Glyoxalase_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006898

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057790029.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790029.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790029.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790029.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790029.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:19845009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B140,B33,B82,D7
`Chr1:19845038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr1:19845163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:19845365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:19845389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr1:19845396`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr1:19845419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B48,D2
`Chr1:19845526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr1:19845569`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	A25,A3,A7,B107,B125,B126,B16,B18,B2,B37,B50,B60,B76,B90,B91,B92,C11,C30,C50,C69
`Chr1:19845618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C3,C63,C67,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790029.1

205 aa

102

205

Glyoxalase

Glyoxalase_4

PF00903 Glyoxalase 46-166 aa PF13669 Glyoxalase_4 47-147 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790029.1`	Pfam	`PF00903`	Glyoxalase	Domain	46	166	1.3e-12	48.8	Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily
`XP_057790029.1`	Pfam	`PF13669`	Glyoxalase_4	Family	47	147	3.9e-07	31.0	Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934046.1
ATATAGAGTAAAAGAGGAAGGGTTTGAAAATTGAGGCAGGTGTGGTGTAGGGTGATGCATGCGTGGCGGCAAACATGTATCTCACACGTGTAATACACGCGTCGTCTCTCCTGTCCTCGCCGCCATCTACATATAGGATGAAATTGAGGAAGAAGAAAGGCAAAATGCAGAAGGCAGAAGAAAAGCAGAATGACGTTCCTCTCATGTCACTCAACCATGTTTCTAGGGTTTGTAGAGCGGTGAAGGAATCGATTGAATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006898
ATGTATCTCACACGTGTAATACACGCGTCGTCTCTCCTGTCCTCGCCGCCATCTACATATAGGATGAAATTGAGGAAGAAGAAAGGCAAAATGCAGAAGGCAGAAGAAAAGCAGAATGACGTTCCTCTCATGTCACTCAACCATGTTTCTAGGGTTTGTAGAGCGGTGAAGGAATCGATTGAATTCTACAGCAAGGTACTAGGCTTCGTGCTGATCAAGCGGCCGGAGTCCTTCGACTTCGACGGCGCGTGGCTCTTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790029.1
MYLTRVIHASSLLSSPPSTYRMKLRKKKGKMQKAEEKQNDVPLMSLNHVSRVCRAVKESIEFYSKVLGFVLIKRPESFDFDGAWLFNYGVGIHLVQSKDEEKLPTDKQRLDPMDNHISFQCEDMEAMVRKLEEMNIKYMKRSVGEGEGAAIDQLFFKDPDGFMIEICNCENMKLVPQRSIGRIKLPSDKHNPPIDLPLKQDMFLA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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