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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000945`

染色体: Chr01 坐标: 20045143-20050294 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000945`
名称	SmilChr01G000945
描述	serine carboxypeptidase-like 40
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	20045143 - 20050294 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006913`
GeneID	`131006913`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006913`
原始查询	`LOC131006913`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine carboxypeptidase-like 40
产物	serine carboxypeptidase-like 40
Arabidopsis	`AT3G63470` (scpl40) serine carboxypeptidase-like 40 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825522] identity=61.5; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0656900` (OsSCP40) - identity=59.6; qcov=0.891; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004185 (serine-type carboxypeptidase activity); GO:0005773 (vacuole); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00450 (Peptidase_S10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006913

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057790037.1`
2	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057790037.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057790037.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790037.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790037.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:20045451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:20045453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C65
`Chr1:20045520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr1:20045546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr1:20046945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B29
`Chr1:20046999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr1:20047823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:20047898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,D8
`Chr1:20048616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790037.1

495 aa

248

495

Peptidase_S10

PF00450 Peptidase_S10 76-486 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790037.1`	Pfam	`PF00450`	Peptidase_S10	Domain	76	486	2.3e-142	476.0	Serine carboxypeptidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934054.1
TCATCCAATCCCAACAATTTTCCATGTTTGTTTAGACTTTGTGATCACATGTATCCAATATTATTCTAATCCACCTCTTTTTGTGAATCTATTTAAACCCCATAATTTCCATCTCCTTAATTTCTCCACTCTCAAACAAAATGTTATTTCTCAGAGCATTATTTCCGTTTGCTTTCGCAATTTTATTATCTCAATGGCCGGAAACCGACGCAACGAAGCAAATCGAAGCTCTCTCACGCATTTACAAAGAGAAGTTGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006913
ATGTTATTTCTCAGAGCATTATTTCCGTTTGCTTTCGCAATTTTATTATCTCAATGGCCGGAAACCGACGCAACGAAGCAAATCGAAGCTCTCTCACGCATTTACAAAGAGAAGTTGCACACAAACAGCATCGACAGACGCCATTTCAATGCGAGCCATCAGTCCCACGTCGTCAGAATTCTCTCTCAAAAAGGGATGAGAGAGAATGACCGGATCGCCAAACTGCCCGGCCAGCCGCCGGTCCGGTTCAAGCAGTACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790037.1
MLFLRALFPFAFAILLSQWPETDATKQIEALSRIYKEKLHTNSIDRRHFNASHQSHVVRILSQKGMRENDRIAKLPGQPPVRFKQYGGYVTVNQTAGRAFYYYFAEAQRAHHKSLPLLLWLNGGPGCSSLAYGAMQELGPFRVHSDGKTLYKNPFSWNHAANLLFLESPAGVGFSYSNTTADFRSGGDAKTAADNYAFLVNWLERFPEYKGRDFYISGESYAGHYVPQLAHTILYHNKKAGKTIINLKGIIIGNAVINDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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