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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001931`

染色体: Chr01 坐标: 34472913-34474261 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001931`
名称	SmilChr01G001931
描述	uncharacterized SmilChr01G001931
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	34472913 - 34474261 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006930`
GeneID	`131006930`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006930`
原始查询	`LOC131006930`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=high
产物	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=55.8; qcov=0.858; evalue=4.13e-126; confidence=high
Rice	`Os06g0597250` - identity=44.6; qcov=0.91; evalue=6.84e-110; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006930

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790053.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057790053.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057790053.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790053.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790053.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:34472950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,A9,C27,C52,C77
`Chr1:34473015`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr1:34473018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A9,B38,C39
`Chr1:34473018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B38,C39
`Chr1:34473041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B135,B40
`Chr1:34473066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C84,D3
`Chr1:34473078`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B10,B137,B37,B54,B81,C40,C6
`Chr1:34473086`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B127
`Chr1:34473086`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B127
`Chr1:34473088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,D10
`Chr1:34473093`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A10,B100,B112,B113,B49,B50,B53,B84,B91,B94,C1,C20,C79,C80,D11,D8
`Chr1:34473100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B126,B135

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790053.1

424 aa

212

424

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 81-118 aa PF04827 Plant_tran 203-363 aa PF13359 DDE_Tnp_4 208-354 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790053.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	81	118	8.4e-20	71.0	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057790053.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	203	363	4.2e-79	265.6	Plant transposon protein
`XP_057790053.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	208	354	4.9e-13	49.7	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934070.1
ATGAATCATCATAATATTGGTTCTTCTTCACTACTTTCTCATTCAAGTTCAAGCTCATCTGATGATGAGCTTGAACAATTAATCAACGAGTGTGATGTTGAACATCAATTGATGGGTCAACATATTTTGAATAACAATCTTATTGTAGCTCAACTGGCTGAATATCAAAATGCTACAAAAATTCATGGAGGTTCAGTTCTTGGTCACAAGGTAATCCATCGTGACCGAGAAGCAGCAGCTCATCGTCTCTTCAACGACTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006930
ATGAATCATCATAATATTGGTTCTTCTTCACTACTTTCTCATTCAAGTTCAAGCTCATCTGATGATGAGCTTGAACAATTAATCAACGAGTGTGATGTTGAACATCAATTGATGGGTCAACATATTTTGAATAACAATCTTATTGTAGCTCAACTGGCTGAATATCAAAATGCTACAAAAATTCATGGAGGTTCAGTTCTTGGTCACAAGGTAATCCATCGTGACCGAGAAGCAGCAGCTCATCGTCTCTTCAACGACTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790053.1
MNHHNIGSSSLLSHSSSSSSDDELEQLINECDVEHQLMGQHILNNNLIVAQLAEYQNATKIHGGSVLGHKVIHRDREAAAHRLFNDYFSENPTFNEGMFRRRFRMSRSLFLRIVDAVKNHNGFFEQRMDCTGRWGLSTVQKITAAFRILAYGVPADATDEYINIGESTAIKCVKKFCRAIVEIFSDQYLRSPNASDVARLLYIGWAGSYAGRSGSPTIILEIVADYDLWIWHAFFGMPGSNNDINVLERSHLFSDLARGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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