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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000978`

染色体: Chr01 坐标: 20678587-20680574 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000978`
名称	SmilChr01G000978
描述	ABC transporter G family member 4-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	20678587 - 20680574 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006941`
GeneID	`131006941`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006941`
原始查询	`LOC131006941`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC transporter G family member 4-like
产物	ABC transporter G family member 4-like
Arabidopsis	`AT5G52860` (ABCG8) ABC-2 type transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835363] identity=67.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0384600` (OsABCG13) - identity=44.9; qcov=1.07; evalue=5.18e-162; confidence=medium
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016020 (membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0140359 (ABC-type transporter activity)
KEGG	smil02010 (ABC transporters - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04981 (Folate transport and metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00005 (ABC_tran); PF01061 (ABC2_membrane); PF19055 (ABC2_membrane_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006941

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057790062.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057790062.1`
3	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057790062.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057790062.1`
5	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057790062.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:20678835`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B30
`Chr1:20678835`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B30
`Chr1:20678878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C1,C44,C57,C70
`Chr1:20678890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,A3,B130,B46,C23
`Chr1:20679013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,C42,C43
`Chr1:20679076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B125,B90,B92,D6
`Chr1:20679084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,C67
`Chr1:20679121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C1,C44,C57,C70
`Chr1:20679157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:20679196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C42
`Chr1:20679298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C2,C32,C68,C8,D4
`Chr1:20679343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790062.1

586 aa

293

586

ABC_tran

ABC2_membrane_7

ABC2_membrane

PF00005 ABC_tran 46-189 aa PF19055 ABC2_membrane_7 219-279 aa PF01061 ABC2_membrane 311-519 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790062.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	46	189	1.1e-29	104.6	ABC transporter
`XP_057790062.1`	Pfam	`PF19055`	ABC2_membrane_7	Family	219	279	7.7e-09	35.6	ABC-2 type transporter
`XP_057790062.1`	Pfam	`PF01061`	ABC2_membrane	Domain	311	519	5.8e-47	160.7	ABC-2 type transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934079.1
AATCATTCTAATTAATCACAACAAGACAAGCAATCACGGACTCAAGATCACTTTGCTGTTTGTTTCCTTGTCATTCTTCTCATTATGAATTGAGAAGTATAGCACACTTTCACTGCCACCTTCACTCCCTTTGCCACTCCATGGAACCACCGCCACCGCCGCCGCCGCCACTTTCCCATACAACCTACACCCTCACGGCCTCCACAATCTCCTACGCCAAACCCGCACCCACCTTCCTCTTCAAGCCCTGCAGCTCCACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006941
ATGGAACCACCGCCACCGCCGCCGCCGCCACTTTCCCATACAACCTACACCCTCACGGCCTCCACAATCTCCTACGCCAAACCCGCACCCACCTTCCTCTTCAAGCCCTGCAGCTCCACGCCACCCACAAACATCCTCAACAACGTCTCCCTCACCGCCCACCCCTCCGAAATCCTCGCCATCGTCGGCCCCAGCGGCGCCGGCAAATCCACCCTCCTCGACATCCTCGCCGCCCGAACGGCTGCCACGAGCGGCGCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790062.1
MEPPPPPPPPLSHTTYTLTASTISYAKPAPTFLFKPCSSTPPTNILNNVSLTAHPSEILAIVGPSGAGKSTLLDILAARTAATSGALLLNSAPLNPSAYRKLSAYVPQHDACLPLLTVAETFAFSAALLNPKSANIPAIVSALLDDLRLTHLAQVRLAHGLSGGERRRVSIGLSLLHDPAVLLLDEPTSGLDSRSALSMMQTLRSVTETRHRTVVLSIHQPSFKILSTIDRILLLAQGSVVHHGTLSSLEDFLLSNGFTV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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