当前解析结果
SmilChr01G000996| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000996 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000996 |
| 描述 | probable disease resistance protein RF9 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 21001451 - 21002862 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131006953 |
|---|---|
| GeneID | 131006953 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006953 |
| 原始查询 | LOC131006953 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable disease resistance protein RF9 |
| 产物 | probable disease resistance protein RF9 |
| Arabidopsis | AT5G35450 (AT5G35450)Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=33.5; qcov=0.897; evalue=7.19e-22; confidence=low |
| Rice | Os08g0193700- identity=29.4; qcov=0.951; evalue=3.17e-12; confidence=low |
| GO | GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF23598 (LRR_14) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006953 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790078.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057790078.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057790078.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790078.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790078.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057790078.1PF23598
LRR_14 9-218 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057790078.1 |
Pfam | PF23598 |
LRR_14 | Repeat | 9 | 218 | 4.4e-14 | 52.7 | Leucine-rich repeat region |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。