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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001008`

染色体: Chr01 坐标: 21200099-21203029 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001008`
名称	SmilChr01G001008
描述	polygalacturonase QRT2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	21200099 - 21203029 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006962`
GeneID	`131006962`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006962`
原始查询	`LOC131006962`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polygalacturonase QRT2-like
产物	polygalacturonase QRT2-like
Arabidopsis	`AT3G07970` (QRT2) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819988] identity=53.1; qcov=0.988; evalue=7.48e-145; confidence=high
Rice	`Os05g0542800` (OsPGL9) - identity=46.8; qcov=0.857; evalue=6.45e-114; confidence=high
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0009901 (anther dehiscence); GO:0010047 (fruit dehiscence); GO:0045490 (pectin catabolic process)
KEGG	smil00040 (Pentose and glucuronate interconversions - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006962

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057790087.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057790087.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790087.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790087.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790087.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:21200183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,C25,D6
`Chr1:21200732`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B58,C51
`Chr1:21201088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B47,B95
`Chr1:21201812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr1:21202236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C53,C78
`Chr1:21202688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B63,C1,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790087.1

406 aa

203

406

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 64-391 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790087.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	64	391	5.8e-100	335.2	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934104.1
TCTTGATAATTTTGATGTGTTGTTTATCCTCCTCATGCTTTGCTAGAAAACATTCTCATCACAAGACGCGCCATGCGAAGAAACGAGCACCTCCAACTCCATATATTGCTCAAAAACAGGTCTTGGATGTCGAGGTTTTTGGAGCTAAAGCTGATGGAAAATCAGATAATTCCGAGGCATTCAAGAAAGCTTGGGACAAAGCTTGTAATTCTTCGGAATCAATGATAATTTTGGTGCCTAAAGGCAAAATTTACTATGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006962
ATGTGTTGTTTATCCTCCTCATGCTTTGCTAGAAAACATTCTCATCACAAGACGCGCCATGCGAAGAAACGAGCACCTCCAACTCCATATATTGCTCAAAAACAGGTCTTGGATGTCGAGGTTTTTGGAGCTAAAGCTGATGGAAAATCAGATAATTCCGAGGCATTCAAGAAAGCTTGGGACAAAGCTTGTAATTCTTCGGAATCAATGATAATTTTGGTGCCTAAAGGCAAAATTTACTATGTTAAGCACATTAATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790087.1
MCCLSSSCFARKHSHHKTRHAKKRAPPTPYIAQKQVLDVEVFGAKADGKSDNSEAFKKAWDKACNSSESMIILVPKGKIYYVKHINFTGPCHSGISLEIQGTIKSFAQMYDIPRRLWIKFEDVKNMEIFGGGTIDGNGEVWWKNSCKIKKTKPCQSQSAPTALTFRNCTNLTVSNLKLLNAQQMHVNFQDCDDVEASRLLVEAPEESPNTDGIHVTRTSNIKILESEIRTGDDCVSIVNGSRNVDVRNIVCGPGHGISIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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