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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001035`

染色体: Chr01 坐标: 21502899-21503822 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001035`
名称	SmilChr01G001035
描述	ferredoxin-thioredoxin reductase subunit A2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	21502899 - 21503822 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006983`
GeneID	`131006983`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006983`
原始查询	`LOC131006983`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ferredoxin-thioredoxin reductase subunit A2, chloroplastic-like
产物	ferredoxin-thioredoxin reductase subunit A2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G08410` (FTRA2) ferredoxin/thioredoxin reductase subunit A (variable subunit) 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830739] identity=50.8; qcov=0.771; evalue=1.48e-33; confidence=medium
Rice	`Os04g0528800` - identity=58.5; qcov=0.494; evalue=1.5e-27; confidence=medium
GO	GO:0015979 (photosynthesis)
KEGG	-
Pfam	PF02941 (FeThRed_A)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006983

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057790109.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057790109.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790109.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790109.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790109.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:21503365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B21
`Chr1:21503458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr1:21503515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790109.1

166 aa

166

FeThRed_A

PF02941 FeThRed_A 86-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790109.1`	Pfam	`PF02941`	FeThRed_A	Domain	86	164	1.7e-25	89.5	Ferredoxin thioredoxin reductase variable alpha chain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934126.1
CATTTCCGCCATCAAATACAATTATCTCGTCTATTTTATTTTTATATATTTTGTCTGGTTTGTAGCTTCAACTGCTGGAATGAGGTCACGAGTCAAACACAAATCCCAAATCCGCACGCAAAAATCTTGGCCAAACCCCTCAGCCATATGAATTGGATAATTTTCTCACCCTTTAATTCCACTCACATAAACGTATAAAAATCTCACCACACACCCACAAACAAATCTTTCCTCCAATTCCCAAAATACCAAAATCCCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006983
ATGGCCGCCTCCACGGCCTTCTTCTCTTCAATTCTCAACCTCCCCACTTCCAAGATCTCAAATTCCGATGTGGGTTTCAACCGGATCCGCTTCTGGGTCCAAAAGAAGCAATCTTTCACTCCGGCAATCCCCATTTCAATCGGCGACGGCATCCCCTCGTCTTCGGGCTCCTGCAATTCAGCTGCAATCTCCAATTCTCTCACTCTCGATCACGACAGCATCAACGATGAGGAGGTTAAGAAGGCGGAGTCGATAATCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790109.1
MAASTAFFSSILNLPTSKISNSDVGFNRIRFWVQKKQSFTPAIPISIGDGIPSSSGSCNSAAISNSLTLDHDSINDEEVKKAESIIGSKVRVKVPLKVYHVPKVPELDLTGRVGLLKQYVGVHKGKRISANLPYKVEFVAEEISGRGGKPVKFLAHLREDEFEFLD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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