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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001036`

染色体: Chr01 坐标: 21551415-21557729 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001036`
名称	SmilChr01G001036
描述	putative zinc transporter At3g08650
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	21551415 - 21557729 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006984`
GeneID	`131006984`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006984`
原始查询	`LOC131006984`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative zinc transporter At3g08650
产物	putative zinc transporter At3g08650
Arabidopsis	`AT3G08650` (AT3G08650) ZIP metal ion transporter family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820012] identity=73.5; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0316100` - identity=68.8; qcov=0.968; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005385 (zinc ion transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0071577 (zinc ion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF02535 (Zip)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006984

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057790110.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057790110.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057790110.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790110.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790110.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:21553016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B110,C50
`Chr1:21553277`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B5
`Chr1:21553277`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B5
`Chr1:21553287`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C13
`Chr1:21553287`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C13
`Chr1:21553314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr1:21554969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:21556498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B111,B65
`Chr1:21556791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr1:21556974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D7
`Chr1:21557054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:21557100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790110.1

590 aa

295

590

Zip

PF02535 Zip 168-290 aa

XP_057790111.1

590 aa

295

590

Zip

PF02535 Zip 168-290 aa

XP_057790112.1

590 aa

295

590

Zip

PF02535 Zip 168-290 aa

XP_057790113.1

590 aa

295

590

Zip

PF02535 Zip 168-290 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790110.1`	Pfam	`PF02535`	Zip	Family	168	290	1.9e-16	60.9	ZIP Zinc transporter
`XP_057790111.1`	Pfam	`PF02535`	Zip	Family	168	290	1.9e-16	60.9	ZIP Zinc transporter
`XP_057790112.1`	Pfam	`PF02535`	Zip	Family	168	290	1.9e-16	60.9	ZIP Zinc transporter
`XP_057790113.1`	Pfam	`PF02535`	Zip	Family	168	290	1.9e-16	60.9	ZIP Zinc transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934130.1
AAAACAACGAAATTTGTCCCCACCATTTTCTCTCTTCTGCTTTTCTTCAATAAAGTCAACATTTTGATAAGAAAATCAGAAAAAGAGAAGAAGCAAAACCCCCCCAAATCTTGTTTCTTTAAAGTGGGGATCCCATAAATTAATTGGGTAAAAGAATAAACGTACAAACAATGGGCGGTCCACGGTTTTAGCTTTCATAAACGAAAATCAGATTGTGAAATACAATTACAAATATGATGATGGTGGTGAGATAGTGCTTG...

XM_057934127.1
TTGTCCCCACCATTTTCTCTCTTCTGCTTTTCTTCAATAAAGTCAACATTTTGATAAGAAAATCAGAAAAAGAGAAGAAGCAAAACCCCCCCAAATCTTGTTTCTTTAAAGTGGGGATCCCATAAATTAATTGGGTAAAAGAATAAACGTACAAACAATGGGCGGTCCACGGTTTTAGCTTTCATAAACGAAAATCAGATTGTGAAATACAATTACAAATATGATGATGGTGGTGAGATAGTGCTTGAATTTTGAATTTT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131006984
ATGGGTTTAAGAGTGAACCTGCTTCTTTTGGTGTTTCTCTCGGTTGTCATATTTGGTCATAGTATAACAGCTGAACAAGAAGAGCAAACTTTACAAAGAGTGATTACTGCTCCTCGGAGGAATGCAGAAGGTGGTGTGATAGATGGATCTGGTACTGAGCATATTGGTGATGAAATGGGTGCATGGCAGGACGGAAATGGTAGAGTCTCAGTGTCAACAGTTGCAATTTTCACGCTGGCAATGGCTGCGGCTACTGGTTT...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057790110.1
MGLRVNLLLLVFLSVVIFGHSITAEQEEQTLQRVITAPRRNAEGGVIDGSGTEHIGDEMGAWQDGNGRVSVSTVAIFTLAMAAATGLGALPFFFMELDPQWAGICNGMAAGVMLAASFDLIQEGQGHGSGSWVVLGILSGGVFILLCKKFLEQYGEMSMLDIKGADATKVILVVGIMTLHSFGEGSGVGVSFAGSKGLSQGLLVTLAIAVHNIPEGLAVSMVLASRGVSPQNAMIWSVITSLPQPLVAVPSFICADAFNK...

XP_057790111.1
MGLRVNLLLLVFLSVVIFGHSITAEQEEQTLQRVITAPRRNAEGGVIDGSGTEHIGDEMGAWQDGNGRVSVSTVAIFTLAMAAATGLGALPFFFMELDPQWAGICNGMAAGVMLAASFDLIQEGQGHGSGSWVVLGILSGGVFILLCKKFLEQYGEMSMLDIKGADATKVILVVGIMTLHSFGEGSGVGVSFAGSKGLSQGLLVTLAIAVHNIPEGLAVSMVLASRGVSPQNAMIWSVITSLPQPLVAVPSFICADAFNK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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