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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001040`

染色体: Chr01 坐标: 21636154-21637788 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001040`
名称	SmilChr01G001040
描述	protein DUF642 L-GALACTONO-1,4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	21636154 - 21637788 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006986`
GeneID	`131006986`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006986`
原始查询	`LOC131006986`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DUF642 L-GALACTONO-1,4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2-like
产物	protein DUF642 L-GALACTONO-1%2C4-LACTONE-RESPONSIVE GENE 2-like
Arabidopsis	`AT3G08030` (AT3G08030) DNA-directed RNA polymerase subunit beta (Protein of unknown function, DUF642) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819994] identity=69.9; qcov=0.919; evalue=2.77e-177; confidence=high
Rice	`Os03g0807700` - identity=62.8; qcov=0.924; evalue=7.38e-156; confidence=high
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF04862 (DUF642)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006986

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057790116.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057790116.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790116.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790116.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790116.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:21636243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr1:21636587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,C17,C8
`Chr1:21636611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B52,C36,C68
`Chr1:21636618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B36,C30,C45
`Chr1:21636636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B34,C87,D4
`Chr1:21636751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr1:21636843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790116.1

369 aa

184

369

DUF642

PF04862 DUF642 29-185 aa PF04862 DUF642 197-363 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790116.1`	Pfam	`PF04862`	DUF642	Domain	29	185	1.4e-80	269.3	Protein of unknown function (DUF642)
`XP_057790116.1`	Pfam	`PF04862`	DUF642	Domain	197	363	1.4e-80	269.3	Protein of unknown function (DUF642)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934133.1
GAACCTCCTCCCTCTTAAACAACAAAACACACATCACACACTTACACACACACACAAATGGCTATGAAGATATGTTTTCTGCTCTCTGTGTACTTTGTCTGTGCTGTTTCAGCCATTGCACCACCTACTCCTCCTTTGGAAGGGCTCCTACCCAATGGGAATTTTGAAGAACAACCATATGCCCAAAACATAAACGAAACAGTGCTCCGAGGTAAGAACGCACTGCCCAAATGGGAAATCAACGGAACGGTGGAGTACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006986
ATGGCTATGAAGATATGTTTTCTGCTCTCTGTGTACTTTGTCTGTGCTGTTTCAGCCATTGCACCACCTACTCCTCCTTTGGAAGGGCTCCTACCCAATGGGAATTTTGAAGAACAACCATATGCCCAAAACATAAACGAAACAGTGCTCCGAGGTAAGAACGCACTGCCCAAATGGGAAATCAACGGAACGGTGGAGTACATCTCCGGCGGCCCTCAGCCCGGAGGGATGTACTACGCTGTGGCGCACGGCGTCCATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790116.1
MAMKICFLLSVYFVCAVSAIAPPTPPLEGLLPNGNFEEQPYAQNINETVLRGKNALPKWEINGTVEYISGGPQPGGMYYAVAHGVHAIRLGSGASISQTVRVRNGSLYALTFGASRTCAQDEVLRVSVPGQTGDLPLQTLYSSNGGDTYAWGFRAYSNSVNLSFYNPGMQEDPACGPLLDAVAIKELFPPRPTLVNLVKNTGFEEGPHILINSSHGVLLPPKQEDWTSPLPGWIIVSLKAVKFIDSEHFNVPYGRAAVEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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