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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001058`

染色体: Chr01 坐标: 21905648-21907081 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001058`
名称	SmilChr01G001058
描述	endo-1,4-beta-xylanase 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	21905648 - 21907081 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007003`
GeneID	`131007003`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007003`
原始查询	`LOC131007003`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endo-1,4-beta-xylanase 5-like
产物	endo-1%2C4-beta-xylanase 5-like
Arabidopsis	`AT4G33830` (AT4G33830) Glycosyl hydrolase family 10 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829525] identity=43.6; qcov=0.913; evalue=1.16e-47; confidence=medium
Rice	`Os03g0243700` - identity=41; qcov=0.961; evalue=4.36e-45; confidence=medium
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00331 (Glyco_hydro_10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007003

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057790128.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790128.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790128.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790128.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790128.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:21906246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B61,C3,C74
`Chr1:21906290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	39	A2,A21,A23,A6,A9,B107,B108,B113,B119,B127,B136,B138,B27,B28,B31,B46,B47,B50,B69,B7,B71,B78,B8,B83,B86,B97,C10,C16,C22,C24,C49,C56,C58,C59,C6,C63,C64,C77,C81
`Chr1:21906292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B139,C37,C5
`Chr1:21906299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr1:21906323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr1:21906348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,C16,C68,D11
`Chr1:21906417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C83,D11
`Chr1:21906451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,A3,C83
`Chr1:21906475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C9
`Chr1:21906548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B134,C79,D3
`Chr1:21906548`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,C79,D3
`Chr1:21906663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B124,B47,C33,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790128.1

231 aa

116

231

Glyco_hydro_10

PF00331 Glyco_hydro_10 17-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790128.1`	Pfam	`PF00331`	Glyco_hydro_10	Domain	17	138	2.5e-10	40.8	Glycosyl hydrolase family 10

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934145.1
ACGGTGTACAGTATGTCTCTGTCAACGTTGAAAGCCTGAGAAAGGCCGTCGGAGCGTGGCGTGTGAATGTTGGAAACGACGGCGTAGCTATTGCCGCACGCTGACTTGGCAGTAGCTATTGTAGCATTTCCAACTGCCGATCCTGGACAACCAAGAATACCAGAGATGGTTCTTGGAGAAAGGGTTCAAATATTCCGCTTTTGAAAACGAGCTCAAATGGCAGTTCACCGAAATCACCCCGGGGGTGGTGAACTACACGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007003
ATGCACTACTCCTTGTACAGCAATGTCACCAACAACGGCACCGACGTCTTCAGACTCCTCCGGCAGCTGGACCCTCATCCCATCCCCTTCCTCAATGAATTCAATGTCATTGAGGATTGCAGCATCCAGTCCAAAGCCAACCCGTGGCAATATCTGCAGAAGATCGACCAGCTCAAAGAAGGAGGCTACGGCGGTCCTCTAGGGATTGGCCTCCAAAGCCATTTCATACTTGAGCCAAACTACCCCTTCATCAGGGCGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790128.1
MHYSLYSNVTNNGTDVFRLLRQLDPHPIPFLNEFNVIEDCSIQSKANPWQYLQKIDQLKEGGYGGPLGIGLQSHFILEPNYPFIRASIDMLHATGLRIWITEFDVNTQKNAWMVKYVEPMLRELHSHPYVKGIIMWAAVWPNISCFRMCLTDNDYNNLPAGDAVDKFMSEFITVPDANGKTDRSGAFEASLFHGEYEASITLPDGSQPPAPQTFNLKPRRDVSVVRFKTPS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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