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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001088`

染色体: Chr01 坐标: 22328507-22331685 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001088`
名称	SmilChr01G001088
描述	uncharacterized SmilChr01G001088
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	22328507 - 22331685 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007024`
GeneID	`131007024`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007024`
原始查询	`LOC131007024`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0798800; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0798800; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G45480` (AT5G45480) transmembrane protein, putative (DUF594) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834584] identity=39.9; qcov=0.52; evalue=1.94e-67; confidence=medium
Rice	`Os01g0798800` - identity=39.9; qcov=1.03; evalue=1.95e-154; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04578 (DUF594); PF13968 (DUF4220)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007024

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057790159.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790159.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790159.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790159.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790159.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:22329168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr1:22329367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr1:22329740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr1:22330705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A8,C25,C74
`Chr1:22330706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A8,C25,C74
`Chr1:22330709`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A14,A8,C25,C74
`Chr1:22330709`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A14,A8,C25,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790159.1

669 aa

334

669

DUF4220

DUF594

PF13968 DUF4220 55-395 aa PF04578 DUF594 600-651 aa

XP_057790160.1

669 aa

334

669

DUF4220

DUF594

PF13968 DUF4220 55-395 aa PF04578 DUF594 600-651 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790159.1`	Pfam	`PF13968`	DUF4220	Family	55	395	1.4e-86	291.9	Domain of unknown function (DUF4220)
`XP_057790159.1`	Pfam	`PF04578`	DUF594	Family	600	651	7.3e-25	87.1	Protein of unknown function, DUF594
`XP_057790160.1`	Pfam	`PF13968`	DUF4220	Family	55	395	1.4e-86	291.9	Domain of unknown function (DUF4220)
`XP_057790160.1`	Pfam	`PF04578`	DUF594	Family	600	651	7.3e-25	87.1	Protein of unknown function, DUF594

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934176.1
TATAGTTTCCCAGAAACCAGACGTCAACTGCTACTTATATATCTCATTGTTCGCTTTCTGGTTTATTAAAGATCATCTATCCTTCCCTTTGCTGAACTTGCTTCTTTGATTATGCTCTCATAAGGTATTACAAAGGGATGAGAATTTCCCCAAAAAGTTGAAATCATCCAAACTACAGAACACTTGTTTTGGCTGATGGGAGAAGTTATGGAAGTATTCCTAGTAGGTTGGATAAACTTCTTGAATGAATGGCAAGTGAG...

XM_057934177.1
TTGTCTGCTCTTCAATCCTTTTGCTCAACTTGCTGCTTTATTTTGATATCTCCCCCTGAAAATTGTGACATTTCCTTATTTGGAAATAATCTTACAAACCATTTTTCTTACTATTTACAAAAAAGATTTGAGACCCAATTTCCACTCAAACATAAAAATTGGGGGAAATATAATCCTTACGCAAGGGCCATCCTATCCAACTTTTAGGCATTAAAATACGTTTCAAGCGCGGATGATTATCATAAGAGATTCCCAACATA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131007024
ATGGGAGAAGTTATGGAAGTATTCCTAGTAGGTTGGATAAACTTCTTGAATGAATGGCAAGTGAGGATGTTCGTTATCCTGAGCCTAGCATTGCAAATTTTACTGGTGTTGTTGGGCAATCGCAGGAAGTATGTATGCAAGGTTTGGATAAGAATCATTATTTGGTGTGCGTACGTATTGGCAGATTGGGTGGCAGTGGTTTCCCTCGGCGTCATCGCGAAGAACACTCTTGATGCATGCGAGAAGAGTATGAATGATAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790159.1
MGEVMEVFLVGWINFLNEWQVRMFVILSLALQILLVLLGNRRKYVCKVWIRIIIWCAYVLADWVAVVSLGVIAKNTLDACEKSMNDKPGIQLNLFWAQFFLVHLGGPDTITAYSLEDNELWLRHLVGMLIHTGLAFYALLVAFPASDWLPYLNLLVFTAGSIKYGERVSTLCAASSENFRDSMLPQPNPGPDYAKFMERYTLKKAEGYNVAVDSVMDMPVLPRHDFPDPPGVPEAYHLFSTFKRLFAGSILSFEDRDCSK...

XP_057790160.1
MGEVMEVFLVGWINFLNEWQVRMFVILSLALQILLVLLGNRRKYVCKVWIRIIIWCAYVLADWVAVVSLGVIAKNTLDACEKSMNDKPGIQLNLFWAQFFLVHLGGPDTITAYSLEDNELWLRHLVGMLIHTGLAFYALLVAFPASDWLPYLNLLVFTAGSIKYGERVSTLCAASSENFRDSMLPQPNPGPDYAKFMERYTLKKAEGYNVAVDSVMDMPVLPRHDFPDPPGVPEAYHLFSTFKRLFAGSILSFEDRDCSK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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