Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001089`

染色体: Chr01 坐标: 22340908-22346205 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001089`
名称	SmilChr01G001089
描述	GDSL esterase/lipase LIP-4-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	22340908 - 22346205 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007025`
GeneID	`131007025`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007025`
原始查询	`LOC131007025`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GDSL esterase/lipase LIP-4-like
产物	GDSL esterase/lipase LIP-4-like
Arabidopsis	`AT1G56670` (AT1G56670) GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842122] identity=46.2; qcov=1.01; evalue=1.13e-107; confidence=high
Rice	`Os01g0329900` (OsGELP14) - identity=41; qcov=0.988; evalue=6.68e-88; confidence=medium
GO	GO:0016788 (hydrolase activity, acting on ester bonds)
KEGG	-
Pfam	PF00657 (Lipase_GDSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007025

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057790161.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790161.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790161.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790161.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790161.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790161.1

341 aa

170

341

Lipase_GDSL

PF00657 Lipase_GDSL 34-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790161.1`	Pfam	`PF00657`	Lipase_GDSL	Family	34	324	4.6e-41	142.0	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934178.1
AAGAATGAAGAATTTAATGATAGTAAGTGCATTAACCAAATAAGTAAATTTGTGTGCATTATCATCTTTTCTTATTCAGCTCTTCTACTTGGATTAGCAAACTCTATTTAAACAACCGCAAACTATTGATTTTTGGCCATCCCATTGCACAACATTTGTTTTTTCTCTCCTTTTGCATCTGCCTTTTCACCCAAGAAGAAGAAAATGTGTTATTCCTATAAAATCTCCCTTGGTCTCGTCTGCTTCTACTTCCTTGGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007025
ATGTGTTATTCCTATAAAATCTCCCTTGGTCTCGTCTGCTTCTACTTCCTTGGCTTTGGCACTATCATGGCAGCGCCGGCGTGTCGCAACAAACCGATGTTATTCAACTTTGGTGATTCGAACAGCGACACAGGAGGCGCTCCTATTCTTGCCGGGATGCCGCTCGAGCTCCCGGCAGGACGCACGTTCTTTCACGAGCCATCCGGCCGTTTATGCGATGGTCGTCTCATCCTCGACTTTCTTTGTGAGAGTCTAGGAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790161.1
MCYSYKISLGLVCFYFLGFGTIMAAPACRNKPMLFNFGDSNSDTGGAPILAGMPLELPAGRTFFHEPSGRLCDGRLILDFLCESLGTKYLTPYLELFATDFSNGVNFALAGSDTLRRVNPLIPYTLQAQTTQFTLFHNVSIRRASIDQIKSALFMLDIGQNDMHGNFMNNKTFQQVLTLIPDVISNIRDAMQTMYRLGGRNFWVHNTGPLGCMPSSVDLINASTVVDQFGCVSDMNKAAAQLNSELERLCRELRSEMGDA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器