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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001955`

染色体: Chr01 坐标: 34795571-34795975 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001955`
名称	SmilChr01G001955
描述	uncharacterized SmilChr01G001955
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	34795571 - 34795975 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007028`
GeneID	`131007028`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007028`
原始查询	`LOC131007028`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007028

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057790166.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790166.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057790166.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790166.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790166.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:34795579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr1:34795584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr1:34795592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr1:34795657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B41
`Chr1:34795728`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B1,B20,B33,C2,C85,D6
`Chr1:34795758`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B1,B54,C2
`Chr1:34795758`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B1,B54,C2
`Chr1:34795786`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A8,B134,B54,B90,C2,C47,C53,C64,C67,C85,D10,D4
`Chr1:34795797`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A5,A8,B54,B90,C2,C47,C53,C64,C67,C85,D10,D4
`Chr1:34795846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C85
`Chr1:34795853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C2,C47,C64,C85,D4
`Chr1:34795892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790166.1

134 aa

134

RVT_3

PF13456 RVT_3 2-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790166.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	2	103	3.7e-10	40.5	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934183.1
ATGCGAAATGCTTTGAATGAGGTTGTGGGGTGCTTTCATTTTGTTGGTGGCAATGGTGCTGCTTTAGAAGCGGATCTGCTCGCGTTCATCAATATTGCCATGGAGTCAACGTTTCGTATGGGGTGGTCTCGGGTCTGGTTTGAGTCGGACTCTTCTTTTGTGGTGCGTTTGCTTCATTCTCATGCTCTCTCGGTGCCTTGGCGTTTTAAAGCCCATTGGAAGAAGGCTCTTAGTTTGGTTTCATTGTACACTTGGAGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007028
ATGCGAAATGCTTTGAATGAGGTTGTGGGGTGCTTTCATTTTGTTGGTGGCAATGGTGCTGCTTTAGAAGCGGATCTGCTCGCGTTCATCAATATTGCCATGGAGTCAACGTTTCGTATGGGGTGGTCTCGGGTCTGGTTTGAGTCGGACTCTTCTTTTGTGGTGCGTTTGCTTCATTCTCATGCTCTCTCGGTGCCTTGGCGTTTTAAAGCCCATTGGAAGAAGGCTCTTAGTTTGGTTTCATTGTACACTTGGAGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790166.1
MRNALNEVVGCFHFVGGNGAALEADLLAFINIAMESTFRMGWSRVWFESDSSFVVRLLHSHALSVPWRFKAHWKKALSLVSLYTWRITHIYRKGNRAADYMASTIMAEGFWTHVIDGLQPLVDDDICKSYTRVV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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