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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001104`

染色体: Chr01 坐标: 22613784-22615277 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001104`
名称	SmilChr01G001104
描述	endo-1,4-beta-xylanase 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	22613784 - 22615277 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007036`
GeneID	`131007036`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007036`
原始查询	`LOC131007036`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endo-1,4-beta-xylanase 5-like
产物	endo-1%2C4-beta-xylanase 5-like
Arabidopsis	`AT4G33830` (AT4G33830) Glycosyl hydrolase family 10 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829525] identity=41.1; qcov=0.996; evalue=1.37e-63; confidence=medium
Rice	`Os03g0243700` - identity=41.5; qcov=1; evalue=2.42e-65; confidence=medium
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00331 (Glyco_hydro_10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007036

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057790170.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790170.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790170.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790170.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790170.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:22614307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr1:22614347`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	A21,A6,B113,B120,B122,B123,B127,B134,B136,B25,B27,B46,B47,B78,B81,B83,B86,B97,C15,C16,C22,C42,C49,C62,C63,C66,C72,C77,C79,C81
`Chr1:22614348`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B130,B15,B21,C24,C62,C64,C7,C76,D11
`Chr1:22614383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B71,B78,B83
`Chr1:22614390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B71,B78,B83
`Chr1:22614429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C3,C74
`Chr1:22614483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C3
`Chr1:22614527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A21,A6,B113,B122,B123,B86,B99,C15,C22,C58
`Chr1:22614625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:22614857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B49,C29
`Chr1:22614911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C29
`Chr1:22614944`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790170.1

283 aa

142

283

Glyco_hydro_10

PF00331 Glyco_hydro_10 2-219 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790170.1`	Pfam	`PF00331`	Glyco_hydro_10	Domain	2	219	4.5e-22	79.4	Glycosyl hydrolase family 10

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934187.1
CATGCTGCAAATTAATGTTAATTAGTATTCTTTTTCAATTAATAACTTAGTGGTAGCAACAAAAAGTAATTAATTAATGAACTACCTGAAACGGTGTACAGTATGTCTCTGTCAACGTTGAAAGCCTGAGAAAGGCCGTCGGAGCGTGCCGTGTGAATGTTGGAAACGACGGTGTAGCTATTGCCGCACGCCGACTTGGCAGTAGCTATTGTAGCATTTCCAACTGCCGATCCTGGACAACCAAGAATACCAGAGATGGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007036
ATGCTGAAGTTTGCGAAAAAGCACCATATCACGCTCCGGGGCCACAACATCCTATGGGAAGACTCCAAGTACCAGGTACAGTGGCAGAAAATGCTGTCGCCGGACGAGCTGTGCGAGGTAGCCCTCAAGCGAGTCAAGTCGGTAGTGACTAAGTACAAGGGGCAGTTCATCCACTGGGATGTTATCAACGAGAACATGCACTACTCCTTGTACAGCAATGTCACCAACAACGGCACCGACGTCTTCAGACTCCTCCGGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790170.1
MLKFAKKHHITLRGHNILWEDSKYQVQWQKMLSPDELCEVALKRVKSVVTKYKGQFIHWDVINENMHYSLYSNVTNNGTDVFRLLRQLDPHPIPFLNEFNVIEDCSIQSKANLREGGYGGPLGIGLQGHFILEPNYPFIRASIDMLHATGLRIWITEFDVNTQKNAWMVKYVEPLLRELHSHPYVKGIIMWAAVWPNISCFRMCLTDNDYNNLPAGDAVMSEFITVPDANWKTDRSGAFEASLFHGEYEASITLPDGSQP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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