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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000263`

染色体: Chr01 坐标: 5059402-5060775 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000263`
名称	SmilChr01G000263
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	5059402 - 5060775 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007040`
GeneID	`131007040`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007040`
原始查询	`LOC131007040`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=32.1; qcov=0.716; evalue=5.6e-53; confidence=low
Rice	`Os11g0681300` - identity=30.2; qcov=0.718; evalue=3.38e-47; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007040

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790195.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790195.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790195.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790195.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790195.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:5059420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr1:5059445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B131,B76
`Chr1:5059447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B76
`Chr1:5059459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:5059476`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B131,C43
`Chr1:5059476`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B131,C43
`Chr1:5059494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B131,B136,B29,C23
`Chr1:5059526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr1:5059537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr1:5059540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:5059550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr1:5059555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790195.1

457 aa

228

457

MULE

SWIM

PF10551 MULE 1-80 aa PF04434 SWIM 278-301 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790195.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	1	80	7.2e-19	68.7	MULE transposase domain
`XP_057790195.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	278	301	0.00032	20.9	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934212.1
ATGATATTTGCACCATTCACGGGGAAGGATAACCATGGCGGTTGCGTTACATTTGCAGCTGGGTTACTAACGAGGGAAGATGTGAGTTCATACTCTTGGATCCTCAAACAATTTGTAGACTGCATGGGTCACACTCCAACTATGTTGATAACAGACCAAGATCCGGCACTAAAGATTGCCGTTGAGAATGTTATGCCGGCCACAAGACACAGATTCTGCATGTGGCACATAATGATGAAGGTGGCTAAGAAGCTTCCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007040
ATGATATTTGCACCATTCACGGGGAAGGATAACCATGGCGGTTGCGTTACATTTGCAGCTGGGTTACTAACGAGGGAAGATGTGAGTTCATACTCTTGGATCCTCAAACAATTTGTAGACTGCATGGGTCACACTCCAACTATGTTGATAACAGACCAAGATCCGGCACTAAAGATTGCCGTTGAGAATGTTATGCCGGCCACAAGACACAGATTCTGCATGTGGCACATAATGATGAAGGTGGCTAAGAAGCTTCCAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790195.1
MIFAPFTGKDNHGGCVTFAAGLLTREDVSSYSWILKQFVDCMGHTPTMLITDQDPALKIAVENVMPATRHRFCMWHIMMKVAKKLPISLQDNAELTSNLYEVAWSEIDEPSAFEEKWTEVINEYGLADHSWFSDMFSLRKYWIPAYFRDLRMSGLFRTTSMSKSENSFFRKYLNWHSNLAAFYIHYESAMQAQRHSYKQLCMIDQTTTPKLKTNKPIEQHASRIYTSKIFLEVQVEIVEAFNRCRTRSMDTGHEEHRYAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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