当前解析结果
SmilChr01G001118| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001118 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001118 |
| 描述 | F-box protein At2g32560-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 22811251 - 22812244 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131007047 |
|---|---|
| GeneID | 131007047 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007047 |
| 原始查询 | LOC131007047 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | F-box protein At2g32560-like |
| 产物 | F-box protein At2g32560-like |
| Arabidopsis | AT2G32560 (AT2G32560)F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817817] identity=70.5; qcov=0.824; evalue=4.4e-24; confidence=medium |
| Rice | Os01g0281000 (OsFbox006)- identity=69.6; qcov=0.757; evalue=4.76e-21; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007047 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057790175.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057790175.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057790175.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790175.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790175.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:22811501 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B121,C39 |
Chr1:22812009 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A15,B18,B71 |
Chr1:22812026 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B74 |
Chr1:22812033 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C62 |
Chr1:22812060 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A15,B18 |
Chr1:22812088 |
G |
GTT |
2bp_insertion | stop_gained,frameshift_variant | 1 | A19 |
Chr1:22812088 |
G |
GTT |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | A19 |
Chr1:22812093 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | A5,C1,C79,C80 |
Chr1:22812093 |
A |
AT |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | A5,C1,C79,C80 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。