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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr01G001148

染色体: Chr01 坐标: 23443102-23449748 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr01G001148
名称SmilChr01G001148
描述uncharacterized SmilChr01G001148
染色体 / SeqIDChr01 / NC_080387.1
坐标与链方向23443102 - 23449748 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131007068
GeneID131007068
locus_tag-
NCBI NameLOC131007068
原始查询LOC131007068

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述BET1P/SFT1P-like protein 14A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824986]; symbol=BS14A; hit=AT3G58170; species=arabidopsis; confidence=low
产物BET1P/SFT1P-like protein 14A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824986]; symbol=BS14A; hit=AT3G58170; species=arabidopsis; confidence=low
ArabidopsisAT3G58170 (BS14A)
BET1P/SFT1P-like protein 14A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824986]
identity=63.4; qcov=0.35; evalue=2.58e-08; confidence=low
RiceOs02g0820700 (P0474F11.16-2)
-
identity=61; qcov=0.35; evalue=5.45e-08; confidence=low
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131007068

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytoplasm 细胞质 0.80000 XP_057790197.1
2 Nucleus 细胞核 0.60000 XP_057790197.1
3 Endoplasmic reticulum 内质网 0.40000 XP_057790194.1
4 Endoplasmic reticulum membrane 内质网膜 0.20000 XP_057790194.1
5 Lipid droplet 脂滴 0.20000 XP_057790194.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr1:23449509 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 A4,B127,B87,C38,D9
Chr1:23449611 C T EMS_canonical_SNV stop_gained 6 B118,B123,B31,B67,C18,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

10 records

下载 cDNA FASTA
XR_009095892.1
CTATCTGAAAGGCTTTTTACAACGCCTCGCTTCAACCCTTACATCTTTTCTCTCACAATTTTACAAACATAGCTTCAGCCGTTACATCTCTCAATTTGTCTCACAATAATCTTCCCAGCCGTTACATCTCTCAATTTCTCTCACAATATGAGTTTCCATCAATCTTCCCACAAATCTCAAACAATCCGCTGTGAAATTGAGAGATTTAGTCTCTCTCGCTCCTTCTCAAACAATTGGCGCAGAATCTTCCCACAAATCTC...
XR_009095891.1
CTATCTGAAAGGCTTTTTACAACGCCTCGCTTCAACCCTTACATCTTTTCTCTCACAATTTTACAAACATAGCTTCAGCCGTTACATCTCTCAATTTGTCTCACAATAATCTTCCCAGCCGTTACATCTCTCAATTTCTCTCACAATATGAGTTTCCATCAATCTTCCCACAAATCTCAAACAATCCGCTGTGAAATTGAGAGATTTAGTCTCTCTCGCTCCTTCTCAAACAATTGGCGCAGAATCTTCCCACAAATCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA
LOC131007068
ATGGCACAAATTTCAATTTCCATGGCACAAATTAGGGATGTGCTTCATCCATGGCTGCAAAAAATTTGGGAGGTGCTTCATCCATGGCTGCACCCCACACTACAGATCCATGATTCAAGGCTATTCCTCTACAAGTGGGCTTTAGAAATTGCAGAGAGAGGGAAAAGTTGCAGGTCATTCTTCGTCCTTGGAGCAAGAACGGTTTTAGGGATCGGGATGCTAGAGTTGCTCTTTCTGATGGTATTGAAGAAGAAGATTCA...
LOC131007068
ATGGCACAAATTTCAATTTCCATGGCACAAATTAGGGATGTGCTTCATCCATGGCTGCAAAAAATTTGGGAGGTGCTTCATCCATGGCTGCACCCCACACTACAGATCCATGATTCAAGTTCTTGGCAGGCTATTCCTCTACAAGTGGGCTTTAGAAATTGCAGAGAGAGGGAAAAGTTGCAGGTCATTCTTCGTCCTTGGAGCAAGAACGGTTTTAGGGATCGGGATGCTAGAGTTGCTCTTTCTGATGGTATTGAAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA
XP_057790194.1
MAQISISMAQIRDVLHPWLQKIWEVLHPWLHPTLQIHDSRLFLYKWALEIAERGKSCRSFFVLGARTVLGIGMLELLFLMVLKKKIQEHHRLIPLMRLVSKRMIEPWKGFTIVISLIFYHSHIDLY
XP_057790197.1
MAQISISMAQIRDVLHPWLQKIWEVLHPWLHPTLQIHDSSSWQAIPLQVGFRNCREREKLQVILRPWSKNGFRDRDARVALSDGIEEEDSRASSSYSSHEIGEQENDRAMEGLHDSY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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