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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001158`

染色体: Chr01 坐标: 23531645-23535868 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001158`
名称	SmilChr01G001158
描述	protein TIC 62, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	23531645 - 23535868 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007077`
GeneID	`131007077`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007077`
原始查询	`LOC131007077`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIC 62, chloroplastic
产物	protein TIC 62%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G31530` (AT4G31530) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829280] identity=71.1; qcov=0.908; evalue=4.1e-150; confidence=high
Rice	`Os05g0110300` - identity=29.8; qcov=0.732; evalue=6.55e-21; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01370 (Epimerase); PF05368 (NmrA); PF13460 (NAD_binding_10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007077

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057790202.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057790202.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790202.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790202.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790202.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:23531785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr1:23531798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	95	A11,A13,A2,A20,A21,A23,A4,A6,A7,B100,B103,B104,B106,B107,B109,B11,B113,B115,B117,B122,B124,B129,B13,B130,B131,B17,B2,B22,B27,B28,B30,B31,B34,B36,B37,B45,B46,B53,B57,B6,B61,B68,B71,B72,B73,B74,B77,B78,B82,B89,B94,B95,B97,C1,C13,C16,C20,C21,C22,C23,C27,C28,C3,C30,C31,C32,C33,C37,C4,C41,C42,C46,C48,C50,C53,C58,C62,C63,C66,C67,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C81,C83,C86,D3,D4,D6,D7,D9
`Chr1:23532134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:23532154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29
`Chr1:23532996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B85
`Chr1:23533793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,C1,C70
`Chr1:23534190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C34
`Chr1:23534216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B85
`Chr1:23534221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B6,D3
`Chr1:23535434`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B86
`Chr1:23535434`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B86
`Chr1:23535437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790202.1

358 aa

179

358

NmrA

Epimerase

NAD_binding_10

PF05368 NmrA 108-186 aa PF01370 Epimerase 111-231 aa PF13460 NAD_binding_10 115-323 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790202.1`	Pfam	`PF05368`	NmrA	Family	108	186	1.8e-07	31.8	NmrA-like family
`XP_057790202.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	111	231	4.2e-08	33.6	NAD dependent epimerase/dehydratase family
`XP_057790202.1`	Pfam	`PF13460`	NAD_binding_10	Domain	115	323	1.4e-30	107.3	NAD(P)H-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934219.1
AAGAGAGGATCCCGATTATGAAATCAGTTTTTTGTGTGCGTGACTACAATTGTGCTTTGATCTTAAACTCATGATTGGCGGTTAACAATGAATTCCATAATAAAATTGGACCACAAAATATATACACTTAATTTTGATGGGTTATTCTCCGTCTCTGAGACGCACACAATTCATGCCATGGCGTCCGCTAGCCTCACACTCTCTCCACCCATTGATCTTCCACTTTCACTAAAAGCTTCCACAAAAACCTCTCAATCACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007077
ATGAATTCCATAATAAAATTGGACCACAAAATATATACACTTAATTTTGATGGGTTATTCTCCGTCTCTGAGACGCACACAATTCATGCCATGGCGTCCGCTAGCCTCACACTCTCTCCACCCATTGATCTTCCACTTTCACTAAAAGCTTCCACAAAAACCTCTCAATCACTCCCTCTATTTCCTCTTCGCCCCCTCAATCCTCCGTCTTCTCCTTACAAGTTTAACAGAAAGGCAGCAGTAGCAGCTTCGCTGTCGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790202.1
MNSIIKLDHKIYTLNFDGLFSVSETHTIHAMASASLTLSPPIDLPLSLKASTKTSQSLPLFPLRPLNPPSSPYKFNRKAAVAASLSREQVFESAATDTNQDSPRPPSSKLVLVVGGTGGVGQLVVASLLDRNVRARLLLRNPEKATTLFGEQDEEKLQVRQGDTRNPEDLDPSIFEGVTHVICCTGTTAFPSRRWDGDNTPERTDWEGVRNLVSALPSSLKRIVLVSSVGVTKFNELPWSIMNLFGVLKYKKMGEDFVRN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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