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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001167`

染色体: Chr01 坐标: 23704897-23715789 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001167`
名称	SmilChr01G001167
描述	magnesium-chelatase subunit ChlD, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	23704897 - 23715789 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007088`
GeneID	`131007088`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007088`
原始查询	`LOC131007088`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	magnesium-chelatase subunit ChlD, chloroplastic-like
产物	magnesium-chelatase subunit ChlD%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G08520` (ALB1) ALBINA 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837374] identity=84.2; qcov=0.95; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0811100` (OsChlD) - identity=82.9; qcov=0.931; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0015995 (chlorophyll biosynthetic process); GO:0016851 (magnesium chelatase activity); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00092 (VWA); PF01078 (Mg_chelatase); PF13519 (VWA_2); PF17863 (AAA_lid_2); PF26791 (AAPxQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007088

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057790226.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057790226.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790226.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790226.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790226.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:23706195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr1:23706753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B27,B3,B73
`Chr1:23710582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C44
`Chr1:23713662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:23713716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:23713757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:23713768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr1:23713931`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B8
`Chr1:23713931`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790226.1

759 aa

380

759

Mg_chelatase

AAA_lid_2

AAPxQ

VWA_2

VWA

PF01078 Mg_chelatase 202-269 aa PF17863 AAA_lid_2 347-411 aa PF26791 AAPxQ 496-550 aa PF13519 VWA_2 559-664 aa PF00092 VWA 559-679 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790226.1`	Pfam	`PF01078`	Mg_chelatase	Domain	202	269	3.3e-11	43.7	Magnesium chelatase, subunit ChlI
`XP_057790226.1`	Pfam	`PF17863`	AAA_lid_2	Domain	347	411	5.2e-15	55.7	AAA lid domain
`XP_057790226.1`	Pfam	`PF26791`	AAPxQ	Domain	496	550	1.9e-19	70.1	AAPxQ domain
`XP_057790226.1`	Pfam	`PF13519`	VWA_2	Domain	559	664	1.3e-12	49.0	von Willebrand factor type A domain
`XP_057790226.1`	Pfam	`PF00092`	VWA	Domain	559	679	1e-06	29.8	von Willebrand factor type A domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934243.1
TGGTGTTGAACTGAGAAATGCGACTTGTTTGAGCAGAAATGGAGTTGAGCAGAAATCCAGAAAGATAAGATAGATAACATCTTTTACTACTTTCCAACTCCTATGATTCTTGGGTAATGGCGCTTTCTTCCCCTCCAATTCCGCCATTTGCTTCTTCAAAATCCCTGCTAAGTTCCAAATCATTCAATCCGCTGCTTGTGCTGTCCCACTCTTTCAGGCCATCAACATATTTTGTGCATGCAAAATGTAGGCGGAGTGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007088
ATGGCGCTTTCTTCCCCTCCAATTCCGCCATTTGCTTCTTCAAAATCCCTGCTAAGTTCCAAATCATTCAATCCGCTGCTTGTGCTGTCCCACTCTTTCAGGCCATCAACATATTTTGTGCATGCAAAATGTAGGCGGAGTGTGGCAGCCGCCGTCACTCTTGATTCCGGCAATGGCTCTGTCACGGTGGAAGACGTAGACGATCAATCTGCCGCCGCCAATGCCAATTCCTATGGCAGACAGTTCTTTCCTTTGGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790226.1
MALSSPPIPPFASSKSLLSSKSFNPLLVLSHSFRPSTYFVHAKCRRSVAAAVTLDSGNGSVTVEDVDDQSAAANANSYGRQFFPLAAVVGQDAIKTALLLGATDREVGGIAISGKRGTAKTVMARGLHAILPPIEVVVGSFANADPACPEEWEDGLSDKLEYDSSGNIKTQIIKSPFVQIPLGVTEDRLIGSVDVEESVKSGTTVFQPGLLAEAHRGVLYVDEINLLDEGISNLLLNVLTEGVNIVEREGISFRHPCKPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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