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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001173`

染色体: Chr01 坐标: 23788479-23792190 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001173`
名称	SmilChr01G001173
描述	salicylate carboxymethyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	23788479 - 23792190 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007090`
GeneID	`131007090`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007090`
原始查询	`LOC131007090`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	salicylate carboxymethyltransferase-like
产物	salicylate carboxymethyltransferase-like
Arabidopsis	`AT4G36470` (AT4G36470) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829799] identity=44.3; qcov=1.03; evalue=7.11e-97; confidence=medium
Rice	`Os02g0719600` (JMT-2) - identity=43.3; qcov=1.04; evalue=4.3e-95; confidence=medium
GO	GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity); GO:0032259 (methylation)
KEGG	-
Pfam	PF03492 (Methyltransf_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007090

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790230.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057790230.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057790230.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790230.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790230.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:23791239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr1:23791244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B123,C15
`Chr1:23791348`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B11,B137,B29,B37,B89,C38,C41,C5,C75,C80
`Chr1:23791438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr1:23791499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr1:23791531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr1:23791920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:23792001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:23792028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790230.1

365 aa

182

365

Methyltransf_7

PF03492 Methyltransf_7 4-362 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790230.1`	Pfam	`PF03492`	Methyltransf_7	Domain	4	362	8.3e-135	450.1	SAM dependent carboxyl methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934247.1
GAGAGAAGAGAGAGAATGGAAGTGGAGCAAGTACTTCACATGAACGGAGGTTTGGGAGATAGTAGTTATGCCAACAACTCATTAGTTCAGGGAAAGATGATAGAAATGACAAAGCCGATAGTAGCAGATGCAATAAGTAAAGTATACCGCAGTTTGGGCTCAAACTCAAAGACGTTGTGCATGGCGGAGTTGGGTTGTTCCTCCGGACCAAACACTCTGCTTGTGGCGGCGGAGTTCGTCAAAACCGTGTACGAGTCGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007090
ATGGAAGTGGAGCAAGTACTTCACATGAACGGAGGTTTGGGAGATAGTAGTTATGCCAACAACTCATTAGTTCAGGGAAAGATGATAGAAATGACAAAGCCGATAGTAGCAGATGCAATAAGTAAAGTATACCGCAGTTTGGGCTCAAACTCAAAGACGTTGTGCATGGCGGAGTTGGGTTGTTCCTCCGGACCAAACACTCTGCTTGTGGCGGCGGAGTTCGTCAAAACCGTGTACGAGTCGAGCCGGAAGCACGGGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790230.1
MEVEQVLHMNGGLGDSSYANNSLVQGKMIEMTKPIVADAISKVYRSLGSNSKTLCMAELGCSSGPNTLLVAAEFVKTVYESSRKHGRELPEFQIFLNDLPGNDFNCISQWLMPKFEEEIGNINGGYCFVYGAPGSFYGRLFPSNTLHFVHSSCSLMWLSKVPQGLEMNKGNVYIGSESPVSVSEAYYAQFRSDFQTFLKCRSEEVVVGGRMVLTILGRKTETAASKECCYIWELLALALKQMVHEGVVEEEIVDSFNIPQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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