当前解析结果
SmilChr01G002005| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002005 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002005 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002005 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 35571231 - 35571737 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131007104 |
|---|---|
| GeneID | 131007104 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007104 |
| 原始查询 | LOC131007104 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820341]; symbol=AT3G11690; hit=AT3G11690; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820341]; symbol=AT3G11690; hit=AT3G11690; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G11690 (AT3G11690)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820341] identity=32.2; qcov=1.05; evalue=3.54e-18; confidence=low |
| Rice | Os12g0621400- identity=33.3; qcov=0.75; evalue=1.74e-06; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007104 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057790244.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057790244.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790244.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790244.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790244.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:35571257 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B61 |
Chr1:35571257 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | B61 |
Chr1:35571710 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B53,C47,C60 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。