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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000084`

染色体: Chr01 坐标: 1589839-1595247 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000084`
名称	SmilChr01G000084
描述	uncharacterized SmilChr01G000084
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	1589839 - 1595247 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007147`
GeneID	`131007147`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007147`
原始查询	`LOC131007147`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828237]; symbol=AT4G21520; hit=AT4G21520; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828237]; symbol=AT4G21520; hit=AT4G21520; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G21520` (AT4G21520) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828237] identity=77.4; qcov=0.512; evalue=4.12e-96; confidence=medium
Rice	`Os03g0738000` (OsWD40-88) - identity=77.2; qcov=0.509; evalue=1.25e-88; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007147

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057790289.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057790289.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057790289.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790289.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790289.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:1590180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C48
`Chr1:1590188`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A5,B1,B28,B55,B84,C18,C21,C61,C85
`Chr1:1590204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,C84
`Chr1:1590293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B104,B28,B71
`Chr1:1590417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B132
`Chr1:1590442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B28
`Chr1:1590442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr1:1590732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr1:1590744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr1:1591466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:1594141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,C61,D5,D9
`Chr1:1594145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B20,C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790289.1

328 aa

164

328

WD40

PF00400 WD40 161-199 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790289.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	161	199	4.7e-12	46.6	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934306.1
ATGTCCACCGTTTCCATTGCCTGTTTCCTCTTCATGGTGCTCTCCGATGTGGTGGTTGATAAGGGGGTTGTTGTTGATTCTGGTTGTGGTGTTGAGGGGGTCCCAACTGGTACTGTTGTTGATGCTGGTTCTGATTATACTGGGGACGTGGCATCGGGTTCTGGTGGATGTATTGATGCTGTTGCAGCTGCAATTCAAGTTCTGGAGATCTCTGTCTTTTTTGGTTTTAAGTCTTTGCCTTATGATAGTCCTATATATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007147
ATGTCCACCGTTTCCATTGCCTGTTTCCTCTTCATGGTGCTCTCCGATGTGGTGGTTGATAAGGGGGTTGTTGTTGATTCTGGTTGTGGTGTTGAGGGGGTCCCAACTGGTACTGTTGTTGATGCTGGTTCTGATTATACTGGGGACGTGGCATCGGGTTCTGGTGGATGTATTGATGCTGTTGCAGCTGCAATTCAAGTTCTGGAGATCTCTGTCTTTTTTGGTTTTAAGTCTTTGCCTTATGATAGTCCTATATATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790289.1
MSTVSIACFLFMVLSDVVVDKGVVVDSGCGVEGVPTGTVVDAGSDYTGDVASGSGGCIDAVAAAIQVLEISVFFGFKSLPYDSPIYYIILIRIFVGYNKAIRIFEVHRPGRDFEQHSTVLGNKEGQSGIISSIVFSPTSSGMLVVGSYNQTTAIYREDNMELLYVLHGQEGGVTQVQFSKDGNYLYSGGRKDPYILCWDIRKTVDIVYKLYRSSESTNQRIQFAIEPLGRYLGTGGQDGLVHIYDLQTGEWVSSFQAALG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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