当前解析结果
SmilChr01G000090| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000090 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000090 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000090 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 1643908 - 1649585 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131007149 |
|---|---|
| GeneID | 131007149 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007149 |
| 原始查询 | LOC131007149 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007149 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057790292.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057790292.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790292.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790292.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790292.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:1648269 |
CTT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B128,B70,C50 |
Chr1:1648269 |
CTT |
C |
2bp_deletion | CDS_variant | 3 | B128,B70,C50 |
Chr1:1648272 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C17,C30,C75 |
Chr1:1648283 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B128,B70,C50 |
Chr1:1648357 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B28,C48,C62,D10 |
Chr1:1648393 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B117,B75 |
Chr1:1648428 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B53 |
Chr1:1648447 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A18,B44,C86 |
Chr1:1648452 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B113 |
Chr1:1648467 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | A3 |
Chr1:1648467 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr1:1648484 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B15,B29,B69,B95,C71 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。