当前解析结果
SmilChr01G000120| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000120 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000120 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000120 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 2043018 - 2043527 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131007158 |
|---|---|
| GeneID | 131007158 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007158 |
| 原始查询 | LOC131007158 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007158 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057790300.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.40000 | XP_057790300.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057790300.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790300.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790300.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:2043043 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | A15 |
Chr1:2043043 |
G |
GA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | A15 |
Chr1:2043044 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A15 |
Chr1:2043047 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A15 |
Chr1:2043049 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A15 |
Chr1:2043077 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B28,B46 |
Chr1:2043083 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A16,B81,C43,C9 |
Chr1:2043103 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B138,B33 |
Chr1:2043111 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C64,C66 |
Chr1:2043120 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B58,B97 |
Chr1:2043137 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B56,B96,C8,D6 |
Chr1:2043191 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B50,D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。