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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002030`

染色体: Chr01 坐标: 35869139-35869921 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002030`
名称	SmilChr01G002030
描述	uncharacterized SmilChr01G002030
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	35869139 - 35869921 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007178`
GeneID	`131007178`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007178`
原始查询	`LOC131007178`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=38.6; qcov=0.983; evalue=1.36e-45; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=53.1; qcov=1.08; evalue=8.03e-95; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007178

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790335.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057790335.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790335.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790335.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790335.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:35869152`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A7,B113,B85
`Chr1:35869152`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A7,B113,B85
`Chr1:35869153`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B59,C38,C82
`Chr1:35869163`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A7,B113,B85
`Chr1:35869163`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A7,B113,B85
`Chr1:35869165`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B3,B59,B65,C38,C82
`Chr1:35869165`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B3,B59,B65,C38,C82
`Chr1:35869176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	47	A15,A25,B100,B101,B104,B123,B131,B139,B19,B22,B24,B27,B28,B30,B34,B44,B50,B52,B53,B55,B62,B68,B69,B84,B86,B88,B9,B98,B99,C1,C15,C19,C22,C25,C26,C40,C44,C45,C50,C59,C65,C85,C9,D11,D4,D5,D8
`Chr1:35869204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	82	A11,A14,A15,A19,A20,A21,A23,A24,A7,B101,B104,B108,B109,B11,B112,B113,B117,B120,B122,B126,B128,B132,B136,B139,B14,B140,B17,B20,B3,B32,B33,B35,B37,B41,B45,B47,B51,B53,B58,B64,B66,B67,B69,B71,B72,B73,B75,B76,B77,B8,B89,B9,B93,B94,B99,C1,C10,C14,C16,C17,C19,C20,C21,C27,C3,C31,C33,C36,C39,C4,C41,C42,C48,C50,C52,C55,C58,C6,C7,C70,C79,C82
`Chr1:35869214`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B44
`Chr1:35869224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B44
`Chr1:35869231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790335.1

240 aa

120

240

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 98-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790335.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	98	240	1.2e-57	195.6	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934352.1
ATGAGCTGGGCGTTATTTCTACACATTGTGAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCCTGATGCTTGTGGGCGTTTTGGCTTCTCACCAATCCAGAAGTGCACAGCGGCGATTCGACAATTGGCGTACGGTACTGTAGCTGATTGTTGTGACGAATATCTTCGTATAGGCAAAACGACGGCGTTGGCGTGCTTGAAGAAATTCTGTAAAGCCGTTGTTCGGAAATTTAGCGGCGTATATTTGAGGAGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007178
ATGAGCTGGGCGTTATTTCTACACATTGTGAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCCTGATGCTTGTGGGCGTTTTGGCTTCTCACCAATCCAGAAGTGCACAGCGGCGATTCGACAATTGGCGTACGGTACTGTAGCTGATTGTTGTGACGAATATCTTCGTATAGGCAAAACGACGGCGTTGGCGTGCTTGAAGAAATTCTGTAAAGCCGTTGTTCGGAAATTTAGCGGCGTATATTTGAGGAGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790335.1
MSWALFLHIVNALEVDPYFQQRPDACGRFGFSPIQKCTAAIRQLAYGTVADCCDEYLRIGKTTALACLKKFCKAVVRKFSGVYLRRPTTADVQRLTAMHKAKHVAWHDAYTRGDQGKPTIILEAVASQDLWIWNAFFGIAGSNNDINILNQSTLFNDVLSGNEAAVHFLANNSHHTRGYYLTDGIYPDWSVFVKSFAFPSDEKKRRFKVMQEAARKDVERAFGILQARWGIIRGSSRLWK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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