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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002038`

染色体: Chr01 坐标: 36008252-36008563 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002038`
名称	SmilChr01G002038
描述	uncharacterized SmilChr01G002038
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	36008252 - 36008563 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007224`
GeneID	`131007224`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007224`
原始查询	`LOC131007224`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0672600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0672600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G20520` (AT4G20520) RNA binding / RNA-directed DNA polymerase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827800] identity=32.9; qcov=0.709; evalue=4.71e-10; confidence=low
Rice	`Os11g0672600` - identity=36.9; qcov=1; evalue=1.56e-17; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007224

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790363.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057790363.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057790363.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057790363.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790363.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:36008297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr1:36008306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr1:36008313`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B51
`Chr1:36008313`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B51
`Chr1:36008317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr1:36008330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:36008336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:36008353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B42,D1,D8
`Chr1:36008356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B117,C57
`Chr1:36008357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	70	A1,A13,A24,A4,A6,A9,B100,B101,B103,B105,B110,B121,B128,B129,B130,B132,B134,B137,B16,B2,B23,B24,B29,B32,B33,B36,B40,B51,B56,B58,B6,B61,B7,B82,B85,B86,B9,B90,B92,B96,C10,C13,C21,C23,C27,C3,C30,C31,C32,C41,C42,C45,C47,C50,C54,C55,C58,C59,C61,C62,C67,C68,C7,C73,C78,C80,C85,D1,D10,D11
`Chr1:36008361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B117,C25,C37,C57
`Chr1:36008362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B85,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790363.1

103 aa

103

RVT_1

PF00078 RVT_1 4-102 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790363.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	4	102	5.2e-11	43.5	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934380.1
ATGGGGTCGATCATTTCGGATAATCAAAGCGCTTTTGTCAAAGGTCGGTTCATTCTCGATGGGGCGGTCATTTTGAATGAGGCTGTTGTTGAGGCAAAAAAGAAGCGACGGAGCTGGATCTTCTTTAAGATCGACTTTGTCAAAGCTTTCGATTCAGTGCAATGGGACTTCTTGGATACCTTACTCGACAGAATGAACTTCGATGGAATTTGGAGGAAATGGATTCAAGGGTGTCTACAGTCAGTCACGGCAAGTGTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007224
ATGGGGTCGATCATTTCGGATAATCAAAGCGCTTTTGTCAAAGGTCGGTTCATTCTCGATGGGGCGGTCATTTTGAATGAGGCTGTTGTTGAGGCAAAAAAGAAGCGACGGAGCTGGATCTTCTTTAAGATCGACTTTGTCAAAGCTTTCGATTCAGTGCAATGGGACTTCTTGGATACCTTACTCGACAGAATGAACTTCGATGGAATTTGGAGGAAATGGATTCAAGGGTGTCTACAGTCAGTCACGGCAAGTGTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790363.1
MGSIISDNQSAFVKGRFILDGAVILNEAVVEAKKKRRSWIFFKIDFVKAFDSVQWDFLDTLLDRMNFDGIWRKWIQGCLQSVTASVLVNGSSTGDFKMERGLR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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