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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000133`

染色体: Chr01 坐标: 2221406-2223960 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000133`
名称	SmilChr01G000133
描述	transcription termination factor MTERF9, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	2221406 - 2223960 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007257`
GeneID	`131007257`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007257`
原始查询	`LOC131007257`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription termination factor MTERF9, chloroplastic-like
产物	transcription termination factor MTERF9%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G79220` (AT1G79220) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844263] identity=48.2; qcov=0.994; evalue=3.46e-111; confidence=high
Rice	`Os02g0749800` - identity=24.8; qcov=0.94; evalue=4.33e-19; confidence=weak
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization)
KEGG	-
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007257

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057790390.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790390.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790390.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790390.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790390.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:2221713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr1:2222548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B34,B52
`Chr1:2222548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B52
`Chr1:2222737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790390.1

406 aa

203

406

mTERF

PF02536 mTERF 91-164 aa PF02536 mTERF 156-363 aa

XP_057790391.1

400 aa

200

400

mTERF

PF02536 mTERF 91-164 aa PF02536 mTERF 156-363 aa

XP_057790392.1

362 aa

181

362

mTERF

PF02536 mTERF 47-120 aa PF02536 mTERF 112-319 aa

XP_057790394.1

334 aa

167

334

mTERF

PF02536 mTERF 19-92 aa PF02536 mTERF 84-291 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790390.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	91	164	6.5e-39	134.4	mTERF
`XP_057790390.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	156	363	6.5e-39	134.4	mTERF
`XP_057790391.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	91	164	6.2e-39	134.5	mTERF
`XP_057790391.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	156	363	6.2e-39	134.5	mTERF
`XP_057790392.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	47	120	4.2e-39	135.0	mTERF
`XP_057790392.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	112	319	4.2e-39	135.0	mTERF
`XP_057790394.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	19	92	3e-39	135.5	mTERF
`XP_057790394.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	84	291	3e-39	135.5	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934407.1
AGCGGAGCAAGCAGCTGCAGCCCATTTGATTTCTTCTTCTTTTCTCTATTTTCATTTTCCCCCAAATTCAGCAGCAGCAGCGGCAAATCTTGTTCTTATCTCTGAGAGTTAATTCGGTTATAATTGAGTTATTGGTAAATAAATGGTACTCTTGCACGCCGCCAGGAGAGGTGCTGCTTTTGTTGCCGGCCGCCGCTTGCACAACCGCACCTCTTCATTTTTCGCTTGTTCATGTACAGGCCTACATAAGCGTCAGAAAA...

XM_057934409.1
GCAGCTGCAGCCCATTTGATTTCTTCTTCTTTTCTCTATTTTCATTTTCCCCCAAATTCAGCAGCAGCAGCGGCAAATCTTGTTCTTATCTCTGAGAGTTAATTCGGTTATAATTGAGTTATTGGTAAATAAATGGTACTCTTGCACGCCGCCAGGAGAGGTGCTGCTTTTGTTGCCGGCCGCCGCTTGCACAACCGCACCTCTTCATTTTTCGCTTGTTCATGGATAGAATTAGCTGGTGATGAGGAGAAATCGAGAGA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131007257
ATGGTACTCTTGCACGCCGCCAGGAGAGGTGCTGCTTTTGTTGCCGGCCGCCGCTTGCACAACCGCACCTCTTCATTTTTCGCTTGTTCATGTACAGGCCTACATAAGCGTCAGAAAACTGATTCAAGTTTCGTGTTTCTCCGCTTTAGCTCATATCCTTATGTTCTTAAACCTGGACATTTTCATACTACATCTTGTGAATCCGTTGAAAGTCTACAAGAAGGGATAGAATTAGCTGGTGATGAGGAGAAATCGAGAGA...

LOC131007257
ATGGTACTCTTGCACGCCGCCAGGAGAGGTGCTGCTTTTGTTGCCGGCCGCCGCTTGCACAACCGCACCTCTTCATTTTTCGCTTGTTCATGGATAGAATTAGCTGGTGATGAGGAGAAATCGAGAGAATCAGCTGACATTTTCCAAGAATGGGGTTGTAGTGAGAGTGATATATCCAAGATTTTTGAGCGACGTTCATCTTTACGTAAGATGGACATTCATATCCTTCGGTCTAAGCTCGACATACTCTCTCGCTTGGG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057790390.1
MVLLHAARRGAAFVAGRRLHNRTSSFFACSCTGLHKRQKTDSSFVFLRFSSYPYVLKPGHFHTTSCESVESLQEGIELAGDEEKSRESADIFQEWGCSESDISKIFERRSSLRKMDIHILRSKLDILSRLGIKSADLVKMVHCRPRLLNCRINIDLNERLAYLEGLFGSKEVLVKAIVRNPSLLIYDFQNKVKPIIAMYESLGLSKEDLITVLLSRPTLIPRTNLNEEKLDYIRRTGVSERSKMYKHVVSIVAISRMETI...

XP_057790391.1
MVLLHAARRGAAFVAGRRLHNRTSSFFACSCTGLHKRQKTDSSFVFLRFSSYPYVLKPGHFHTTSCESVESLQEGIELAGDEEKSRESADIFQEWGCSESDISKIFERRSSLRKMDIHILRSKLDILSRLGIKSADLVKMVHCRPRLLNCRINIDLNERLAYLEGLFGSKEVLVKAIVRNPSLLIYDFQNKVKPIIAMYESLGLSKEDLITVLLSRPTLIPRTNLNEEKLDYIRRTGVSERSKMYKHVVSIVAISRMETI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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