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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000134`

染色体: Chr01 坐标: 2270643-2271913 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000134`
名称	SmilChr01G000134
描述	short-chain dehydrogenase reductase 3b-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	2270643 - 2271913 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007258`
GeneID	`131007258`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007258`
原始查询	`LOC131007258`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	short-chain dehydrogenase reductase 3b-like
产物	short-chain dehydrogenase reductase 3b-like
Arabidopsis	`AT2G47140` (SDR5) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819327] identity=60; qcov=0.859; evalue=7.29e-113; confidence=high
Rice	`Os03g0833100` - identity=58; qcov=0.882; evalue=1.31e-94; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007258

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057790395.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057790395.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790395.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790395.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790395.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:2270749`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A25,B32,B36
`Chr1:2270749`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A25,B32,B36
`Chr1:2270979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr1:2271146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B41,B53,B65,C76
`Chr1:2271568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,B68,B99,C75
`Chr1:2271629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790395.1

297 aa

148

297

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 42-228 aa PF08659 KR 44-204 aa PF13561 adh_short_C2 48-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790395.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	42	228	3.2e-48	164.5	short chain dehydrogenase
`XP_057790395.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	44	204	2e-10	41.6	KR domain
`XP_057790395.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	48	285	3.1e-59	201.1	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934412.1
AATTGACTGTAATTAGAAAGGTTGCAATTTTACACGTGGATTCCTCGAGCTGTGAAACCTACCAAAAGTCCTAAGTACTTAATAAAAATTCCTTGATTCATGTTTTTAAAAGACGAGACAGCAGATCCAAGAAGCTTATTTTCTGCAATCAAATCGCTCTTAACTTCTCACGTAATTGGATCACGCACTCATCCCGCAATGTCAAAGCCAAGGTTGGAAGGCAAGGTCGCGCTCATCACCGGCGCCGCCAGCGGCATCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007258
ATGTTTTTAAAAGACGAGACAGCAGATCCAAGAAGCTTATTTTCTGCAATCAAATCGCTCTTAACTTCTCACGTAATTGGATCACGCACTCATCCCGCAATGTCAAAGCCAAGGTTGGAAGGCAAGGTCGCGCTCATCACCGGCGCCGCCAGCGGCATCGGCGAGGAGGCCACGCGGCTCTTCGTGGAGCACGGCGCCGCCGTGGTGGTAGCCGACATCCAAGACGAGCTCGCCCATCAGGTCATCGCCTCGATGGACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790395.1
MFLKDETADPRSLFSAIKSLLTSHVIGSRTHPAMSKPRLEGKVALITGAASGIGEEATRLFVEHGAAVVVADIQDELAHQVIASMDSDRASYRRCDVRDEAQVAAAVAYAVEKYGGLDILFSNAGTLGPVASILDLDIQAMDKVLATNVLGVAATIKHAARSMVARGVRGSIICTASVAACVGGSGPHAYSAAKCAVVGLARSACGELGRHGIRVNCISPFGVATPMVCGAYGAAPEEIEANSCAAANLKGIVLKTRHIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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