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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000153`

染色体: Chr01 坐标: 2596844-2599067 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000153`
名称	SmilChr01G000153
描述	uncharacterized SmilChr01G000153
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	2596844 - 2599067 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007270`
GeneID	`131007270`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007270`
原始查询	`LOC131007270`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tolB protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828228]; symbol=AT4G01870; hit=AT4G01870; species=arabidopsis; confidence=high
产物	tolB protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828228]; symbol=AT4G01870; hit=AT4G01870; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G01870` (AT4G01870) tolB protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828228] identity=58.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0638100` (OJ1340_C08.105) - identity=53.9; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07676 (PD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007270

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057790405.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057790405.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790405.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790405.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790405.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:2597099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B98,C14
`Chr1:2597111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr1:2597111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:2597117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:2597167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:2597188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr1:2597207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C26
`Chr1:2597230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B6
`Chr1:2597249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B33,B98,C14
`Chr1:2597253`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	58	A13,A14,A16,A22,A5,A7,A8,B100,B103,B108,B111,B117,B122,B124,B126,B127,B128,B131,B136,B15,B16,B18,B27,B31,B34,B44,B46,B5,B50,B60,B66,B7,B73,B79,B84,B88,B9,B97,B98,C1,C11,C19,C20,C36,C43,C45,C47,C49,C58,C59,C69,C82,C85,C86,D2,D4,D6,D9
`Chr1:2597255`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	58	A13,A14,A16,A22,A5,A7,A8,B100,B103,B108,B111,B117,B122,B124,B126,B127,B128,B131,B136,B15,B16,B18,B27,B31,B34,B44,B46,B5,B50,B60,B66,B7,B73,B79,B84,B88,B9,B97,B98,C1,C11,C19,C20,C36,C43,C45,C47,C49,C58,C59,C69,C82,C85,C86,D2,D4,D6,D9
`Chr1:2597284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790405.1

643 aa

322

643

PD40

PF07676 PD40 410-563 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790405.1`	Pfam	`PF07676`	PD40	Repeat	410	563	1.2e-37	130.2	TolB beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934422.1
CTAGTCACTTGCTTGATGAATTGATTGCTCACATCAGTCCATACGCATTTCACTATTACACACTTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATTGTAAATGAAATTTAAATTCCCTCCACCACTATCACATTTTCCTCCACTTGATTAATTAATCACCTTCTTATTGCACTATTTCGCCAATATGGAACCAACCGGCACAATACTCTTCAACACCGTCGGCAGAGCCTTTTACTGCTTCGATATATTCGCCGTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007270
ATGGAACCAACCGGCACAATACTCTTCAACACCGTCGGCAGAGCCTTTTACTGCTTCGATATATTCGCCGTCGAGCTGCCTCGACAGCTCGACGAAGATCAGACTTGGTCCGAGCACCGCCTCACCGACGGTGTATCCATCAACTTCAACGGCCAGTTCGTTGATGACCACAAAACTCTTGTTTACATCTCCGAGCGAACCGGTTCGCCTCGCATTTTCCTAAATCAATCCGAAGATATCGATGCCGAACATCTCTATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790405.1
MEPTGTILFNTVGRAFYCFDIFAVELPRQLDEDQTWSEHRLTDGVSINFNGQFVDDHKTLVYISERTGSPRIFLNQSEDIDAEHLYSPPESLFHDRPVIKNRRLYFISAHEQPEKPFTSWSALYSTMLDDKTTTRLTPYGTVDYSPAVSPSGKLIAVASYGRKAWGGEFHEIDTDIVVFSESDPTSRAVVCQHGGWPSWWSDSILYFHREAEDGWWSIFRADLSHDFASSPPVVPVRITPPGVHCFTPAAVHGNKRIVVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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