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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000165`

染色体: Chr01 坐标: 2733779-2735810 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000165`
名称	SmilChr01G000165
描述	60S ribosomal protein L18-2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	2733779 - 2735810 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007279`
GeneID	`131007279`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007279`
原始查询	`LOC131007279`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L18-2
产物	60S ribosomal protein L18-2
Arabidopsis	`AT3G05590` (RPL18) ribosomal protein L18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819725] identity=84; qcov=1; evalue=7.78e-117; confidence=high
Rice	`Os03g0341100` - identity=80.2; qcov=1; evalue=7.3e-110; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00828 (Ribosomal_L27A); PF17135 (Ribosomal_L18)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007279

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790409.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057790409.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790409.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790409.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790409.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:2734184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B76,D10
`Chr1:2734801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B76,D10
`Chr1:2735575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr1:2735656`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A10,B100,B110,B114,B19,B23,B84,B87,B94,D2
`Chr1:2735657`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	A11,A13,A9,B100,B108,B127,B49,B68,B69,C11,C25,C39,C48,C57,C8,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790409.1

187 aa

187

Ribosomal_L18

Ribosomal_L27A

PF17135 Ribosomal_L18 2-187 aa PF00828 Ribosomal_L27A 95-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790409.1`	Pfam	`PF17135`	Ribosomal_L18	Family	2	187	1.4e-93	312.3	Ribosomal protein 60S L18 and 50S L18e
`XP_057790409.1`	Pfam	`PF00828`	Ribosomal_L27A	Domain	95	119	3.3e-05	25.0	Ribosomal proteins 50S-L15, 50S-L18e, 60S-L27A

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934426.1
AATTTTATGTTTGATGAGCCAAATCCACAGCGGGCCCAATAATATTGGGCTACTTAGAGCTCTAGGGTTCGCAGCCCATTCAATACCGCATATAGCCGCTCCGCTTTATAACTCCAACACTACAAAACCCTAATTTTCTCTTCCCTTAACACTCCAGAGCAGGTACAGAAGCGGCACGCGAGAGAAGAAGCAGCAGCAGCAGCAATGGGTATCGACTTGGTCGCCGGAGGTAAGGTCAAGAAGACCAAGCGTACAGCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007279
ATGGGTATCGACTTGGTCGCCGGAGGTAAGGTCAAGAAGACCAAGCGTACAGCGCCGAAATCCAACGATATCTACCTCAAACTCCTCGTGAAGTTGTACCGTTTTTTGGTGAGGAGAACTGGAAGCAAATTTAATGCGGTTGTTCTGAAGAGACTATTCATGAGCAGGATTAACAGGCCCCCGCTCTCTCTCTCCCGCCTCAGCGCACTCATGAATGGGAAGGAAGATAAGATTGCAGTACTTGTAGGAAGTGTTACCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790409.1
MGIDLVAGGKVKKTKRTAPKSNDIYLKLLVKLYRFLVRRTGSKFNAVVLKRLFMSRINRPPLSLSRLSALMNGKEDKIAVLVGSVTDDIRVHDIPKMKVAALRFTERARARIEKVGGECLTFDQLALRAPLGQNTVLLRGSRNAREAVKHFGPAPGVPHSHTKPYVRAKGRKFERARGKRNSRGFRV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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