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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000170`

染色体: Chr01 坐标: 2800890-2804009 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000170`
名称	SmilChr01G000170
描述	uncharacterized SmilChr01G000170
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	2800890 - 2804009 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007281`
GeneID	`131007281`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007281`
原始查询	`LOC131007281`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828063]; symbol=AT4G02340; hit=AT4G02340; species=arabidopsis; confidence=high
产物	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828063]; symbol=AT4G02340; hit=AT4G02340; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G02340` (AT4G02340) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828063] identity=67.5; qcov=1; evalue=1.07e-174; confidence=high
Rice	`Os01g0255000` - identity=60.7; qcov=1; evalue=8.89e-148; confidence=high
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007281

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057790410.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790410.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790410.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790410.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790410.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:2801324`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B11,C27,C41
`Chr1:2801324`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B11,C27,C41
`Chr1:2802226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:2802228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:2802322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr1:2802328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790410.1

317 aa

158

317

Abhydrolase_1

Hydrolase_4

Abhydrolase_6

PF00561 Abhydrolase_1 25-131 aa PF12146 Hydrolase_4 26-146 aa PF12697 Abhydrolase_6 27-306 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790410.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	25	131	1.6e-27	97.4	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057790410.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	26	146	1.1e-11	45.2	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057790410.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	27	306	1.4e-20	75.6	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009096012.1
ATTATCACTCCTCAAAATTTAAAATTACTAAGTCAAAATTCACTCTCACAGCAACCAAGAAAACTAGTTGAAAATTTGAGTAGTACTCGCACGAACATCATCATCAAACATGGAGAAAATCCGGCATAGAAATATCCAAGCAAACGGCATAAACATCCACGTGGCGGAGATCGGCGACGGCCCCGCCGTCCTGCTCCTCCACGGCTTCCCGGAGCTCTGGTACTCGTGGCGCCACCAGATGCTATTCCTCTCTTCCAAGG...

XM_057934427.1
GTCAAAATTCACTCTCACAGCAACCAAGAAAACTAGTTGAAAATTTGAGTAGTACTCGCACGAACATCATCATCAAACATGGAGAAAATCCGGCATAGAAATATCCAAGCAAACGGCATAAACATCCACGTGGCGGAGATCGGCGACGGCCCCGCCGTCCTGCTCCTCCACGGCTTCCCGGAGCTCTGGTACTCGTGGCGCCACCAGATGCTATTCCTCTCTTCCAAGGGCTACCGTGCTATCGCTCCCGACCTCCGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007281
ATGGAGAAAATCCGGCATAGAAATATCCAAGCAAACGGCATAAACATCCACGTGGCGGAGATCGGCGACGGCCCCGCCGTCCTGCTCCTCCACGGCTTCCCGGAGCTCTGGTACTCGTGGCGCCACCAGATGCTATTCCTCTCTTCCAAGGGCTACCGTGCTATCGCTCCCGACCTCCGCGGCTTCGGCGATTCCGACGCGCCGCCCTCCGCTTCCAGCTATACCGTCTTCCACATAATCGGCGATTTGGTCGGCGTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790410.1
MEKIRHRNIQANGINIHVAEIGDGPAVLLLHGFPELWYSWRHQMLFLSSKGYRAIAPDLRGFGDSDAPPSASSYTVFHIIGDLVGVLDALGLDRVFLVGHDWGAVMAWNFCLLRPDRIRALVNTSVVFQPRNPRRKPLETMRTFLGDDYYICRFQEPGEAEEEFSRVDTARLIKKFLTSRNPAPLRVPKAVGFGGSPDKPITMPSWLSEEDVSYYAIKYNQRGFTGGLNYYRAMDLNWEVTAPWTGVQIKVPVKFIIGDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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