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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000201`

染色体: Chr01 坐标: 3466943-3469274 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000201`
名称	SmilChr01G000201
描述	60S ribosomal protein L19-1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	3466943 - 3469274 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007302`
GeneID	`131007302`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007302`
原始查询	`LOC131007302`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L19-1-like
产物	60S ribosomal protein L19-1-like
Arabidopsis	`AT3G16780` (AT3G16780) Ribosomal protein L19e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820931] identity=84.4; qcov=1; evalue=3.38e-126; confidence=high
Rice	`Os03g0579300` - identity=90.5; qcov=0.948; evalue=4.97e-119; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01280 (Ribosomal_L19e); PF25476 (Ribosomal_L19e_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007302

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790426.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057790426.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057790426.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790426.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790426.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:3468158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C18
`Chr1:3468549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr1:3468690`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	56	A16,A23,B101,B102,B104,B109,B119,B120,B124,B125,B126,B127,B140,B19,B2,B22,B24,B26,B29,B32,B36,B53,B58,B6,B65,B67,B68,B69,B7,B78,B83,B86,B9,B90,B92,B95,C12,C14,C17,C26,C29,C41,C44,C49,C51,C57,C6,C64,C66,C67,C76,C77,C79,C85,C9,D3
`Chr1:3468695`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C59,D1
`Chr1:3468695`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C59,D1
`Chr1:3469074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790426.1

212 aa

106

212

Ribosomal_L19e

Ribosomal_L19e_C

PF01280 Ribosomal_L19e 4-54 aa PF25476 Ribosomal_L19e_C 56-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790426.1`	Pfam	`PF01280`	Ribosomal_L19e	Domain	4	54	2.3e-28	98.6	Ribosomal protein L19e, N-terminal domain
`XP_057790426.1`	Pfam	`PF25476`	Ribosomal_L19e_C	Domain	56	146	4.8e-35	120.4	Ribosomal protein L19e, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934443.1
CCGTATAAAATCTTATCATCATTCCTACACAGTTCATTTGCCATCTGCACACCCACCACCGGGGAAACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAGAGATGGTGTCGCTTAAGCTGCAGAAGCGGCTCGCCGCCAGCGTATTGAAGTGTGGCAAGGGCAAGGTTTGGCTTGATCCAAATGAAGTCAACGAAATCTCCATGGCCAACTCTCGACAAAATATTAGGAAGTTGGTCAAGGATGGTTTCATCATCAGGAAGCCAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007302
ATGGTGTCGCTTAAGCTGCAGAAGCGGCTCGCCGCCAGCGTATTGAAGTGTGGCAAGGGCAAGGTTTGGCTTGATCCAAATGAAGTCAACGAAATCTCCATGGCCAACTCTCGACAAAATATTAGGAAGTTGGTCAAGGATGGTTTCATCATCAGGAAGCCAACAAAGATCCATTCACGTTCCCGTGCCCGCCGCATGAAGGAGGCCAAGAGAAAGGGACGTCACTCAGGATATGGTAAGCGCAAGGGTACCCGGGAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790426.1
MVSLKLQKRLAASVLKCGKGKVWLDPNEVNEISMANSRQNIRKLVKDGFIIRKPTKIHSRSRARRMKEAKRKGRHSGYGKRKGTREARLPTKILWMRRMRVLRRLLRKYREAKKIDKHMYHDMYMKVKGNVFKNKRVLMESIHKSKAEKAREKTLSDQFEAKRAKNKASRERKFARREERLAQGPGEKVAPPAAAAPAPTSQQAQPAKKSKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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