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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000218`

染色体: Chr01 坐标: 3794511-3799399 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000218`
名称	SmilChr01G000218
描述	uncharacterized SmilChr01G000218
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	3794511 - 3799399 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007319`
GeneID	`131007319`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007319`
原始查询	`LOC131007319`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT5G49220; symbol=AT5G49220; hit=AT5G49220; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	AT5G49220; symbol=AT5G49220; hit=AT5G49220; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G49220` (AT5G49220) - identity=39.7; qcov=0.994; evalue=1.3e-69; confidence=medium
Rice	`Os07g0246600` - identity=40; qcov=1.03; evalue=1.16e-65; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05623 (DUF789)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007319

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057790438.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057790439.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057790438.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790439.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790439.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:3795051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr1:3796422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:3797919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr1:3797970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:3798056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B35,B83
`Chr1:3798848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B35,B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790438.1

430 aa

215

430

DUF789

PF05623 DUF789 115-423 aa

XP_057790439.1

355 aa

178

355

DUF789

PF05623 DUF789 115-345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790438.1`	Pfam	`PF05623`	DUF789	Family	115	423	9e-88	295.5	Protein of unknown function (DUF789)
`XP_057790439.1`	Pfam	`PF05623`	DUF789	Family	115	345	4.7e-71	240.6	Protein of unknown function (DUF789)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934455.1
AAATTGCCGTCTTCTTTCTCCCCCCAATTTTACAAGCAGCCATTAATTTTTGCTTTTCCAAACATACCCCCAACTGAGAAACAATCCAAAACAGGCAACGGAAAAAGCACACAGTCACACAGTAGTAAGTCATAACCTTCCAGGCTTCCACCTCCTCACACACACACACACACACACTAACAAACCCTTTCAAAAACCTCCAAGAAATTCCAATTTCCCAAATTCACTTTAATTCAATCTCATTTCAATCACATCTGGAT...

XM_057934456.1
TTTCTCCCCCCAATTTTACAAGCAGCCATTAATTTTTGCTTTTCCAAACATACCCCCAACTGAGAAACAATCCAAAACAGGCAACGGAAAAAGCACACAGTCACACAGTAGTAAGTCATAACCTTCCAGGCTTCCACCTCCTCACACACACACACACACACACTAACAAACCCTTTCAAAAACCTCCAAGAAATTCCAATTTCCCAAATTCACTTTAATTCAATCTCATTTCAATCACATCTGGATTTCTTCAATCCTTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131007319
ATGCCAAGTAAGGGAGGGTACGCGGCGGCGGCGCTGCCGCCGCGGCAGGGCGGGGACAGGTTCTACAACCCGCCGGCGGTTCGGCGCCAGCAAATACTTTTGCAGCAGCAGCAGCCGCAAGTGATGCAGGGGCAAGTGCTTCAACAACAGCAGCAGCAAGAGCAAGAGCAACAATTGCCGCAGCAGAAGCGGAAAATGCAGCGGATGGGGAGGGCGAAGGTGAAGGCGGAGTCTGCTTCCTCCACGTTGGCGGTGGAGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790438.1
MPSKGGYAAAALPPRQGGDRFYNPPAVRRQQILLQQQQPQVMQGQVLQQQQQQEQEQQLPQQKRKMQRMGRAKVKAESASSTLAVEKPADVDDSSVVAALTVPRSVSPASSLKVTNLDRLMESVTPFIEARYSSEVYARGFRTTEVDSHTFFYLEDLWESFSEWSVYGRGVPLLLYGRDPIQQYYVPFLSGIQLYIDPSRASTRTNGTTQEHAHLRRLMSTVGSGNCERDRDANYVFDLNLQHLSSRFSVGDGVSSKADT...

XP_057790439.1
MPSKGGYAAAALPPRQGGDRFYNPPAVRRQQILLQQQQPQVMQGQVLQQQQQQEQEQQLPQQKRKMQRMGRAKVKAESASSTLAVEKPADVDDSSVVAALTVPRSVSPASSLKVTNLDRLMESVTPFIEARYSSEVYARGFRTTEVDSHTFFYLEDLWESFSEWSVYGRGVPLLLYGRDPIQQYYVPFLSGIQLYIDPSRASTRTNGTTQEHAHLRRLMSTVGSGNCERDRDANYVFDLNLQHLSSRFSVGDGVSSKADT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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