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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002120`

染色体: Chr01 坐标: 37220717-37221475 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002120`
名称	SmilChr01G002120
描述	uncharacterized SmilChr01G002120
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37220717 - 37221475 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007574`
GeneID	`131007574`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007574`
原始查询	`LOC131007574`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=52.1; qcov=0.571; evalue=1.47e-34; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=56.5; qcov=0.94; evalue=7.88e-92; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007574

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790465.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790465.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790465.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790465.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790465.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37220738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B62,C30,C38,C76
`Chr1:37220743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,C3
`Chr1:37220744`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr1:37220763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,A2,C5,C72
`Chr1:37220792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B58,B88,C67,C82
`Chr1:37220804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,A5,A8
`Chr1:37220809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C77
`Chr1:37220815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B37,B90,C77
`Chr1:37220816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,A5,A8
`Chr1:37220835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,A5,A8,B110
`Chr1:37220839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr1:37220840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790465.1

252 aa

126

252

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 30-69 aa PF04827 Plant_tran 137-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790465.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	30	69	1e-18	67.5	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057790465.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	137	248	4.1e-47	161.2	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934482.1
ATGACAGTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGAGGAAGAAGCAGACAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTTTCTGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGCCATCGATTTCGCATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCCGGATGCTATTGGCCGCTTAAGCTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007574
ATGACAGTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGAGGAAGAAGCAGACAGTGGTTCGTCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTTTCTGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGCCATCGATTTCGCATGAGCCGGGAGTTGTTTCTACGCATTGTCAATGCGCTAGAAGTCGATCCTTACTTCCAACAACGTCCGGATGCTATTGGCCGCTTAAGCTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790465.1
MTVASSYRFDPPPPRPRKKQTVVRRDREGGAERLHRDYFSVEPVYGPQFFRHRFRMSRELFLRIVNALEVDPYFQQRPDAIGRLSFSPIQKCTAAVRQLAYGTAVDCCDEYLRIGETTALECLKKFCKAVVRIFGGTYLRRPTTADVQRITAMHEARNGFPGMLGNLDCMHWGWKNCPVAWHGAYTRGDQGEPTIILEAVASQDLWIWHAFFGVAGSNNDINVLHQSTLFNGVLAGHEAAVHFLANNSHHTR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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