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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002130`

染色体: Chr01 坐标: 37299917-37301157 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002130`
名称	SmilChr01G002130
描述	scarecrow-like protein 32
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37299917 - 37301157 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007587`
GeneID	`131007587`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007587`
原始查询	`LOC131007587`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	scarecrow-like protein 32
产物	scarecrow-like protein 32
Arabidopsis	`AT3G49950` (AT3G49950) GRAS family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824157] identity=42.8; qcov=1.1; evalue=7.1e-72; confidence=medium
Rice	`Os07g0589200` - identity=37.7; qcov=1.16; evalue=3.89e-60; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007587

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790480.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057790480.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057790480.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790480.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790480.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37299925`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr1:37299925`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D11
`Chr1:37299926`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A10,A15,A25,A3,A5,B123,B134,B137,B19,B21,B35,B40,B49,B76,C3,C32,C33,C37,C45,C46,C47,C51,C58,C62,C68,C77,C9,D4
`Chr1:37299928`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	121	A13,A14,A18,A20,A22,A23,A5,A7,A9,B1,B10,B101,B102,B103,B107,B111,B112,B118,B119,B120,B125,B128,B13,B130,B132,B133,B135,B136,B139,B14,B140,B16,B17,B18,B20,B23,B24,B26,B29,B3,B31,B36,B37,B45,B47,B5,B51,B53,B54,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B65,B7,B72,B73,B74,B77,B80,B82,B9,B90,B92,B95,B97,B98,C11,C13,C16,C22,C24,C25,C27,C28,C3,C31,C32,C33,C34,C37,C38,C40,C43,C44,C45,C48,C5,C50,C55,C56,C59,C6,C60,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C72,C73,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,D10,D11,D4,D6,D7,D8,D9
`Chr1:37299933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,D5
`Chr1:37299958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B48,D5
`Chr1:37300392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:37300452`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B64,B83,C50
`Chr1:37300452`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B64,B83,C50
`Chr1:37300454`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A3,B100,B113,B118,B25,B33,B55,B66,B72,B78,B8,B99,C19,C20,C61
`Chr1:37300459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,C16,C64,C66
`Chr1:37300468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B80,C22,C56,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790480.1

276 aa

138

276

GRAS

PF03514 GRAS 34-91 aa PF03514 GRAS 125-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790480.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	34	91	1.6e-34	120.2	GRAS domain family
`XP_057790480.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	125	266	1.6e-34	120.2	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934497.1
ATGGTGATGCCGGTGGAGATAGAGGAGGTCTTATCCATGTGGACCGACATTCCCCTTGTGAAAATGGAGACGCTCAGCAGCTTCGGCGACGCGAACTGCATGGAGCAGTTGCTGGTGCACTGCGCCACGGCCATAGAGACCAACGACGCAACCCTAGCCCAGCAGATTCTCTGGGTCCTCAACATCATCGCCCCTCCCGACGGCAACTCGAGCCAACGCCTCACCAGCGCCTTCCTCCGTGCCCTCATTGCTCGCGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007587
ATGGTGATGCCGGTGGAGATAGAGGAGGTCTTATCCATGTGGACCGACATTCCCCTTGTGAAAATGGAGACGCTCAGCAGCTTCGGCGACGCGAACTGCATGGAGCAGTTGCTGGTGCACTGCGCCACGGCCATAGAGACCAACGACGCAACCCTAGCCCAGCAGATTCTCTGGGTCCTCAACATCATCGCCCCTCCCGACGGCAACTCGAGCCAACGCCTCACCAGCGCCTTCCTCCGTGCCCTCATTGCTCGCGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790480.1
MVMPVEIEEVLSMWTDIPLVKMETLSSFGDANCMEQLLVHCATAIETNDATLAQQILWVLNIIAPPDGNSSQRLTSAFLRALIARAARSGSCKLLTAVANVNAVDLSTTNHKFSIIELVGYVNLTYEELGLKIVNFAKSQNVAMEFREILSSSSEGFSSLIEQLRAIGTGAGGEALIINCQMMLHYIPGETRANASNSLRTIFLKAVRGLNSKAVVVVDEDANLMSGNLMSRLRAAYNYLGIPYDTVETFLLPESRQQQW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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